Basic Information
Symbol
OPALIN
RNA Class
mRNA
Alias
oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein
TMP10
HTMP10
transmembrane protein 10
TMEM10
opalin
transmembrane protein TMP10
Opalin
Oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein
Transmembrane protein 10
Location (GRCh38)
10:96343216-96359365
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_033207.5
Sequence length
3252 nt
GC Content
0.4376
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-943.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1009.79 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
788.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001040102.3 | GUCAGUUAACUGUUCCUACAAAUGAAAGACACAAGCCAAUAAAGCCAGU… | 3183 nt | 0.4358 |
| NM_001040103.3 | GUCAGUUAACUGUUCCUACAAAUGAAAGACACAAGCCAAUAAAGCCAGU… | 3291 nt | 0.4391 |
| NM_001284320.2 | GUCAGUUAACUGUUCCUACAAAUGAAAGACACAAGCCAAUAAAGCCAGU… | 3219 nt | 0.4365 |
| NM_001284321.2 | GUCAGUUAACUGUUCCUACAAAUGAAAGACACAAGCCAAUAAAGCCAGU… | 3216 nt | 0.4369 |
| NM_001284322.2 | GUCAGUUAACUGUUCCUACAAAUGAAAGACACAAGCCAAUAAAGCCAGU… | 3334 nt | 0.4388 |
| NM_001284323.2 | AGUGCAGCGACCAUCCAGUGUCCUUGCAGCACGUGUUGGUCUGGUGCUA… | 3432 nt | 0.4484 |
| NM_001284324.2 | AGUGCAGCGACCAUCCAGUGUCCUUGCAGCACGUGUUGGUCUGGUGCUA… | 3325 nt | 0.4451 |
| NM_001284326.2 | AGUGCAGCGACCAUCCAGUGUCCUUGCAGCACGUGUUGGUCUGGUGCUA… | 3393 nt | 0.4471 |
| NM_001284327.2 | AGUGCAGCGACCAUCCAGUGUCCUUGCAGCACGUGUUGGUCUGGUGCUA… | 3286 nt | 0.4437 |
| NM_033207.5 | GUCAGUUAACUGUUCCUACAAAUGAAAGACACAAGCCAAUAAAGCCAGU… | 3252 nt | 0.4376 |
Summary
Predicted to be involved in regulation of oligodendrocyte differentiation. Located in Golgi apparatus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
