Basic Information

Symbol
ARHGEF12
RNA Class
mRNA
Alias
Rho guanine nucleotide exchange factor 12 KIAA0382 LARG Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 12 PRO2792 KMT2A/ARHGEF12 fusion protein leukemia-associated RhoGEF leukemia-associated rho guanine nucleotide exchange factor Leukemia-associated RhoGEF
Location (GRCh38)
11:120336238-120489937 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001198665.2
BLAST PRIMER
NM_001301084.2
BLAST PRIMER
NM_015313.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_015313.3
Sequence length
10326 nt
GC Content
0.4363

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3076.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -3276.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2544.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
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NM_001301084.2 AUCUGACAAAUGCCUUUCCAAGGAUGUCGAAUGUAUAUAUAAAGAAAAA… 9623 nt 0.4146
NM_015313.3 AGAACCCGGCGAGCCGGCCCUGCGCCGGGAGACGCCGCCGCCUCCGCCU… 10326 nt 0.4363
Summary

Rho GTPases play a fundamental role in numerous cellular processes that are initiated by extracellular stimuli working through G protein-coupled receptors. The encoded protein may form a complex with G proteins and stimulate Rho-dependent signals. This protein has been observed to form a myeloid/lymphoid fusion partner in acute myeloid leukemia. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2014]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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