Basic Information

Symbol
PAPPA2
RNA Class
mRNA
Alias
pappalysin 2 PAPPE PAPP-A2 placenta-specific 3 PAPP-E PLAC3 SSDA pappalysin-2 pregnancy-associated plasma preproprotein-A2 pregnancy-associated plasma protein E1 Pappalysin-2 Pregnancy-associated plasma protein A2 Pregnancy-associated plasma protein E1 EC 3.4.24.-
Location (GRCh38)
1:176463171-176845601 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_020318.3
BLAST PRIMER
NM_021936.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_020318.3
Sequence length
9683 nt
GC Content
0.4867

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3220.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -3389.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2906.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_020318.3 AUGACUCUCUCUCUUGAGUAGGCACACACUCCCUUUUCUCGGGUGUGUA… 9683 nt 0.4867
NM_021936.3 AUGACUCUCUCUCUUGAGUAGGCACACACUCCCUUUUCUCGGGUGUGUA… 4366 nt 0.4977
Summary

This gene encodes a member of the pappalysin family of metzincin metalloproteinases. The encoded protein cleaves insulin-like growth factor-binding protein 5 and is thought to be a local regulator of insulin-like growth factor (IGF) bioavailability. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2010]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image