Basic Information

Symbol
PCCA
RNA Class
mRNA
Alias
propionyl-CoA carboxylase subunit alpha propionyl Coenzyme A carboxylase, alpha polypeptide propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial PCCase alpha subunit pccA complementation group propanoyl-CoA:carbon dioxide ligase alpha subunit propionyl CoA carboxylase, alpha polypeptide propionyl-CoA carboxylase alpha subunit Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial PCCase subunit alpha Propanoyl-CoA:carbon dioxide ligase subunit alpha EC 6.4.1.3 EC 6.4.1
Location (GRCh38)
13:100089015-100530437 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_000282.4
BLAST PRIMER
NM_001127692.3
BLAST PRIMER
NM_001178004.2
BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
NM_001352612.2
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_000282.4
Sequence length
2484 nt
GC Content
0.4444

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-734.97 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -780.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 694.4
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
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NM_001127692.3 AGCAGAGGGGCGGUCUGCGGGGACAACAAUGGCGGGGUUCUGGGUCGGG… 2406 nt 0.4464
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NM_001352605.2 AGCAGAGGGGCGGUCUGCGGGGACAACAAUGGCGGGGUUCUGGGUCGGG… 2430 nt 0.4444
NM_001352606.2 AGCAGAGGGGCGGUCUGCGGGGACAACAAUGGCGGGGUUCUGGGUCGGG… 2340 nt 0.4406
NM_001352607.2 AGCAGAGGGGCGGUCUGCGGGGACAACAAUGGCGGGGUUCUGGGUCGGG… 2265 nt 0.4424
NM_001352608.2 AGCAGAGGGGCGGUCUGCGGGGACAACAAUGGCGGGGUUCUGGGUCGGG… 2262 nt 0.4425
NM_001352609.2 AGCAGAGGGGCGGUCUGCGGGGACAACAAUGGCGGGGUUCUGGGUCGGG… 2096 nt 0.4523
NM_001352610.2 AGCAGAGGGGCGGUCUGCGGGGACAACAAUGGCGGGGUUCUGGGUCGGG… 2405 nt 0.4407
NM_001352611.2 AGCAGAGGGGCGGUCUGCGGGGACAACAAUGGCGGGGUUCUGGGUCGGG… 2351 nt 0.4407
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary

The protein encoded by this gene is the alpha subunit of the heterodimeric mitochondrial enzyme Propionyl-CoA carboxylase. PCCA encodes the biotin-binding region of this enzyme. Mutations in either PCCA or PCCB (encoding the beta subunit) lead to an enzyme deficiency resulting in propionic acidemia. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, May 2010]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image