Basic Information

Symbol
PGA3
RNA Class
mRNA
Alias
pepsinogen A3 pepsin A pepsinogen 3, group I (pepsinogen A) pepsin A-3 pepsinogen-3 Pepsin A-3 Pepsinogen-3 EC 3.4.23.1
Location (GRCh38)
11:61203307-61213098 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001079807.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001079807.4
Sequence length
1613 nt
GC Content
0.5592

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-567.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -591.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 343.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001079807.4 ACCUUCCUCCCGUCUUGCCUUCUCCCUCGAGUUGGGACCCGGGAAGAAC… 1613 nt 0.5592
Summary

This gene encodes a protein precursor of the digestive enzyme pepsin, a member of the peptidase A1 family of endopeptidases. The encoded precursor is secreted by gastric chief cells and undergoes autocatalytic cleavage in acidic conditions to form the active enzyme, which functions in the digestion of dietary proteins. This gene is found in a cluster of related genes on chromosome 11, each of which encodes one of multiple pepsinogens. Pepsinogen levels in serum may serve as a biomarker for atrophic gastritis and gastric cancer. [provided by RefSeq, Jul 2015]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image