Basic Information
Symbol
PGA5
RNA Class
mRNA
Alias
pepsinogen A5
pepsin A
pepsinogen 5, group I (pepsinogen A)
Pg5
pepsin A-5
Pepsin A-4
Pepsinogen-4
pepsinogen-5
Pepsin A-5
Pepsinogen-5
EC 3.4.23.1
Location (GRCh38)
11:61241175-61251444
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_014224.5
Sequence length
1382 nt
GC Content
0.5695
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-469.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-494.2 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
285.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_014224.5 | GCACCUUCCUCCCAUCUUGCCUUCUCCCUCGAGUUGGGACCCGGGAAGA… | 1382 nt | 0.5695 |
Summary
This gene encodes a protein precursor of the digestive enzyme pepsin, a member of the peptidase A1 family of endopeptidases. The encoded precursor is secreted by gastric chief cells and undergoes autocatalytic cleavage in acidic conditions to form the active enzyme, which functions in the digestion of dietary proteins. This gene is found in a cluster of related genes on chromosome 11, each of which encodes one of multiple pepsinogens. Pepsinogen levels in serum may serve as a biomarker for atrophic gastritis and gastric cancer. [provided by RefSeq, Jul 2015]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
