Basic Information
Symbol
PGK1
RNA Class
mRNA
Alias
phosphoglycerate kinase 1
HEL-S-68p
MIG10
PGKA
PRP 2
cell migration-inducing gene 10 protein
epididymis secretory sperm binding protein Li 68p
primer recognition protein 2
Phosphoglycerate kinase 1
Cell migration-inducing gene 10 protein
Primer recognition protein 2
EC 2.7.2.3
Location (GRCh38)
X:77910739-78129295
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000291.4
Sequence length
4812 nt
GC Content
0.4281
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1436.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1529.08 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1383.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_000291.4 | GUUCCGCAUUCUGCAAGCCUCCGGAGCGCACGUCGGCAGUCGGCUCCCU… | 4812 nt | 0.4281 |
Summary
The protein encoded by this gene is a glycolytic enzyme that catalyzes the conversion of 1,3-diphosphoglycerate to 3-phosphoglycerate. The encoded protein may also act as a cofactor for polymerase alpha. Additionally, this protein is secreted by tumor cells where it participates in angiogenesis by functioning to reduce disulfide bonds in the serine protease, plasmin, which consequently leads to the release of the tumor blood vessel inhibitor angiostatin. The encoded protein has been identified as a moonlighting protein based on its ability to perform mechanistically distinct functions. Deficiency of the enzyme is associated with a wide range of clinical phenotypes hemolytic anemia and neurological impairment. Pseudogenes of this gene have been defined on chromosomes 19, 21 and the X chromosome. [provided by RefSeq, Jan 2014]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
