Basic Information

Symbol
PIP5K1A
RNA Class
mRNA
Alias
phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 alpha phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type I, alpha phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 alpha 68 kDa type I phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase alpha PIP5K1-alpha PIP5KIalpha phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type I alpha ptdIns(4)P-5-kinase 1 alpha Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 alpha PtdIns(4)P-5-kinase 1 alpha Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type I alpha EC 2.7.1.68 EC 2.7.1
Location (GRCh38)
1:151197949-151249538 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001135636.2
BLAST PRIMER
NM_001135637.2
BLAST PRIMER
NM_001135638.2
BLAST PRIMER
NM_001330689.2
BLAST PRIMER
NM_003557.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001135638.2
Sequence length
3800 nt
GC Content
0.4716

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1235.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1309.4 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 946.2
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001135636.2 GAUUUUUUGCUUGGCUACCCGGAGUGAAGCGGCCGGGUUGGGCGAUUAA… 3680 nt 0.4726
NM_001135637.2 GAUUUUUUGCUUGGCUACCCGGAGUGAAGCGGCCGGGUUGGGCGAUUAA… 3614 nt 0.4696
NM_001135638.2 GAUUUUUUGCUUGGCUACCCGGAGUGAAGCGGCCGGGUUGGGCGAUUAA… 3800 nt 0.4716
NM_001330689.2 GAUUUUUUGCUUGGCUACCCGGAGUGAAGCGGCCGGGUUGGGCGAUUAA… 3764 nt 0.4721
NM_003557.3 GAUUUUUUGCUUGGCUACCCGGAGUGAAGCGGCCGGGUUGGGCGAUUAA… 3761 nt 0.4719
Summary

Enables 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase activity and kinase binding activity. Involved in several processes, including activation of GTPase activity; focal adhesion assembly; and ruffle assembly. Located in several cellular components, including lamellipodium; nucleus; and ruffle membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image