Basic Information

Symbol
PLAT
RNA Class
mRNA
Alias
plasminogen activator, tissue type plasminogen activator, tissue T-PA TPA tissue-type plasminogen activator alteplase plasminogen/activator kringle reteplase t-plasminogen activator Tissue-type plasminogen activator t-PA tPA Alteplase Reteplase EC 3.4.21.68 EC 3.4.21
Location (GRCh38)
8:42174718-42207709 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_000930.5
BLAST PRIMER
NM_000931.2
BLAST PRIMER
NM_001319189.2
BLAST PRIMER
NM_033011.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_000930.5
Sequence length
3062 nt
GC Content
0.5229

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1062.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1122.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 840.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_000930.5 AGAGCUGAGAUCCUACAGGAGUCCAGGGCUGGAGAGAAAACCUCUGCGA… 3062 nt 0.5229
NM_000931.2 AUGGCCCUGUCCACUGAGCAUCCUCCCGCCACACAGAAACCCGCCCAGC… 2160 nt 0.5301
NM_001319189.2 AGAGCUGAGAUCCUACAGGAGUCCAGGGCUGGAGAGAAAACCUCUGCGA… 2795 nt 0.5131
NM_033011.4 AGAGCUGAGAUCCUACAGGAGUCCAGGGCUGGAGAGAAAACCUCUGCGA… 2924 nt 0.5233
Summary

This gene encodes tissue-type plasminogen activator, a secreted serine protease that converts the proenzyme plasminogen to plasmin, a fibrinolytic enzyme. The encoded preproprotein is proteolytically processed by plasmin or trypsin to generate heavy and light chains. These chains associate via disulfide linkages to form the heterodimeric enzyme. This enzyme plays a role in cell migration and tissue remodeling. Increased enzymatic activity causes hyperfibrinolysis, which manifests as excessive bleeding, while decreased activity leads to hypofibrinolysis, which can result in thrombosis or embolism. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants, at least one of which encodes an isoform that is proteolytically processed. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image