Basic Information
Symbol
PPIA
RNA Class
mRNA
Alias
peptidylprolyl isomerase A
CYPA
cyclophilin A
Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A
CYPH
HEL-S-69p
PPIase A
T cell cyclophilin
cyclosporin A-binding protein
epididymis secretory sperm binding protein Li 69p
peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A)
rotamase A
Cyclophilin A
Cyclosporin A-binding protein
Rotamase A
EC 5.2.1.8
Location (GRCh38)
7:44796678-44824564
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_021130.5
Sequence length
2237 nt
GC Content
0.4595
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-784 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-818.65 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
408.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001300981.2 | GUUUUGCAGACGCCACCGCCGAGGAAAACCGUGUACUAUUAGCCAUGGU… | 2394 nt | 0.4570 |
| NM_021130.5 | GUUUUGCAGACGCCACCGCCGAGGAAAACCGUGUACUAUUAGCCAUGGU… | 2237 nt | 0.4595 |
| NM_203430.1 | GGCCAGGCUCGUGCCGUUUUGCAGACGCCACCGCCGAGGAAAACCGUGU… | 1796 nt | 0.4655 |
| NM_203431.1 | AGGCCAGGCUCGUGCCGUUUUGCAGACGCCACCGCCGAGGAAAACCGUG… | 1707 nt | 0.4681 |
Summary
This gene encodes a member of the peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase) family. PPIases catalyze the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides and accelerate the folding of proteins. The encoded protein is a cyclosporin binding-protein and may play a role in cyclosporin A-mediated immunosuppression. The protein can also interact with several HIV proteins, including p55 gag, Vpr, and capsid protein, and has been shown to be necessary for the formation of infectious HIV virions. Multiple pseudogenes that map to different chromosomes have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
