Basic Information

Symbol
PPP1R15A
RNA Class
mRNA
Alias
protein phosphatase 1 regulatory subunit 15A GADD34 growth arrest and DNA-damage-inducible 34 protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 15A protein phosphatase 1, regulatory subunit 15A growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD34 myeloid differentiation primary response protein MyD116 homolog Protein phosphatase 1 regulatory subunit 15A Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD34 Myeloid differentiation primary response protein MyD116 homolog
Location (GRCh38)
19:48872212-48876291 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_014330.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_014330.5
Sequence length
2350 nt
GC Content
0.5902

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-920.91 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -957.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 508.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_014330.5 GCUCUUAUCGGUUCCCAUCCCAGUUGUUGAUCUUAUGCAAGACGCUGCA… 2350 nt 0.5902
Summary

This gene is a member of a group of genes whose transcript levels are increased following stressful growth arrest conditions and treatment with DNA-damaging agents. The induction of this gene by ionizing radiation occurs in certain cell lines regardless of p53 status, and its protein response is correlated with apoptosis following ionizing radiation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image