Basic Information

Symbol
PRELID2
RNA Class
mRNA
Alias
PRELI domain containing 2 MGC21644 FLJ38376 PRELI domain-containing protein 2 CTC-806A22.1
Location (GRCh38)
5:145471799-145835369 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_138492.6
BLAST PRIMER
NM_182960.4
BLAST PRIMER
NM_205846.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_205846.3
Sequence length
4817 nt
GC Content
0.3978

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1413.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1504.9 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1356.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_138492.6 GAGUGUGGGCGCCUCCGGGCCUCUGCGGAGCCCUGGGCAGCUCUGAGCU… 5020 nt 0.4010
NM_182960.4 GAGUGUGGGCGCCUCCGGGCCUCUGCGGAGCCCUGGGCAGCUCUGAGCU… 4853 nt 0.3977
NM_205846.3 GAGUGUGGGCGCCUCCGGGCCUCUGCGGAGCCCUGGGCAGCUCUGAGCU… 4817 nt 0.3978
Summary

Predicted to enable phosphatidic acid transfer activity. Predicted to be involved in phospholipid transport. Predicted to be active in mitochondrial intermembrane space. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image