Basic Information
Symbol
ABCG1
RNA Class
mRNA
Alias
ATP binding cassette subfamily G member 1
ABC8
ATP-binding cassette transporter 8
ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 1
WHITE1
ATP-binding cassette sub-family G member 1
ABC transporter 8
ATP-binding cassette transporter member 1 of subfamily G
homolog of Drosophila white
white protein homolog (ATP-binding cassette transporter 8)
WHT1
White protein homolog
EC 7.6.2.-
Location (GRCh38)
21:42199689-42304389
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_016818.3
Sequence length
2976 nt
GC Content
0.5494
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1130 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1180.02 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
657.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_004915.4 | GGAGCCCAAGCGCAGCCCGCACCCCGCGCAGCGGCUGAGCCGGGAGCCA… | 3012 nt | 0.5475 |
| NM_016818.3 | GGAGCCCAAGCGCAGCCCGCACCCCGCGCAGCGGCUGAGCCGGGAGCCA… | 2976 nt | 0.5494 |
| NM_207174.1 | GCGAGGGGCAAGCCCGGAUUCCUGCCGGCCGCCUUUCUGCGCGCGCCGG… | 2983 nt | 0.5374 |
| NM_207627.2 | AGACACUGAAUCAUCAUUUGUAGUUUGGGGGGCUUUACAUGCCUGCAGU… | 3119 nt | 0.5293 |
| NM_207628.1 | ACUUCAGAGGGCAGCAGCUGGACUACCUAUGUUUGUGGCGCUACACCAA… | 3060 nt | 0.5294 |
| NM_207629.2 | GCUUUAUAAAGGGGAGUUUCCCUGCACAAGCUCUCUCUCUUGUCUGCCG… | 2923 nt | 0.5344 |
| NM_207630.1 | UUCUUUCCAAGGGUCUCUGGGUGAGGCCCGUGACCUUCCCAAGCCUCUC… | 3498 nt | 0.5334 |
Summary
The protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This protein is a member of the White subfamily. It is involved in macrophage cholesterol and phospholipids transport, and may regulate cellular lipid homeostasis in other cell types. Six alternative splice variants have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
