Basic Information
Symbol
ARSA
RNA Class
mRNA
Alias
arylsulfatase A
ASA
metachromatic leucodystrophy
MLD
cerebroside-sulfatase
epididymis secretory sperm binding protein
Arylsulfatase A
Cerebroside-sulfatase
EC 3.1.6.8
EC 3.1.6
Location (GRCh38)
22:50622754-50628177
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000487.6
Sequence length
4294 nt
GC Content
0.5990
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2036.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2104.53 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1294.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001085425.3 | GAGGCGGAAGCGCCCGCAGCCCGGUACCGGCUCCUCCUGGGCUCCCUCU… | 4189 nt | 0.5978 |
| NM_001085426.3 | GAGGCGGAAGCGCCCGCAGCCCGGUACCGGCUCCUCCUGGGCUCCCUCU… | 4141 nt | 0.5962 |
| NM_001085427.3 | GAGGCGGAAGCGCCCGCAGCCCGGUACCGGCUCCUCCUGGGCUCCCUCU… | 4096 nt | 0.5947 |
| NM_001085428.3 | GAGGCGGAAGCGCCCGCAGCCCGGUACCGGCUCCUCCUGGGCUCCCUCU… | 3904 nt | 0.5920 |
| NM_001362782.2 | GAGGCGGAAGCGCCCGCAGCCCGGUACCGGCUCCUCCUGGGCUCCCUCU… | 3859 nt | 0.5903 |
| NM_000487.6 | GAGGCGGAAGCGCCCGCAGCCCGGUACCGGCUCCUCCUGGGCUCCCUCU… | 4294 nt | 0.5990 |
Summary
The protein encoded by this gene hydrolyzes cerebroside sulfate to cerebroside and sulfate. Defects in this gene lead to metachromatic leucodystrophy (MLD), a progressive demyelination disease which results in a variety of neurological symptoms and ultimately death. Alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2010]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
