Basic Information
Symbol
PRH2
RNA Class
mRNA
Alias
proline rich protein HaeIII subfamily 2
Pr
parotid proline-rich protein
acidic salivary proline-rich protein, HaeIII type, 2
PRP-1/PRP-2
pr1/Pr2
salivary acidic proline-rich phosphoprotein 1/2
parotid acidic protein
parotid double-band protein
parotid proline-rich protein 1/2
protein C
Salivary acidic proline-rich phosphoprotein 1/2
Db-s
Parotid acidic protein
Pa
Parotid double-band protein
Parotid isoelectric focusing variant protein
PIF-S
Parotid proline-rich protein 1/2
Pr1/Pr2
Protein C
Location (GRCh38)
12:10929236-10934845
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001110213.1
Sequence length
3177 nt
GC Content
0.3680
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-737.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-803.61 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
920.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001110213.1 | AGCAUAAAGUUGGGAGUGACACCAGAGCCUUCUGCAAGAUGCUUCUGAU… | 3177 nt | 0.3680 |
| NM_005042.4 | CAGCAUAAAGUUGGGAGUGACACCAGAGCCUUCUGCAAGAUGCUUCUGA… | 4323 nt | 0.3659 |
Summary
This gene encodes a member of the heterogeneous family of proline-rich salivary glycoproteins. The encoded preproprotein undergoes proteolytic processing to generate one or more mature isoforms before secretion from the parotid and submandibular/sublingual glands. In western population this locus is commonly biallelic and encodes proline-rich protein (PRP) isoforms, PRP-1 and PRP-2. The reference genome encodes the PRP-1 allele. Certain alleles of this gene are associated with susceptibility to dental caries. This gene is located in a cluster of closely related salivary proline-rich proteins on chromosome 12. [provided by RefSeq, Oct 2015]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
