Basic Information
Symbol
PRKCI
RNA Class
mRNA
Alias
protein kinase C iota
PKCI
protein kinase C, iota
DXS1179E
nPKC-iota
protein kinase C iota type
PRKC-lambda/iota
aPKC-lambda/iota
atypical protein kinase C-lambda/iota
Protein kinase C iota type
Atypical protein kinase C-lambda/iota
EC 2.7.11.13
EC 2.7.11
Location (GRCh38)
3:170222124-170305978
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_002740.6
Sequence length
4887 nt
GC Content
0.3874
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1323.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1421.69 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1647.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_002740.6 | GACGCAGGAGGUGUCUUGGGCCCGGGCGGCUGUAGAGGCGGCGGCGCCU… | 4887 nt | 0.3874 |
Summary
This gene encodes a member of the protein kinase C (PKC) family of serine/threonine protein kinases. The PKC family comprises at least eight members, which are differentially expressed and are involved in a wide variety of cellular processes. This protein kinase is calcium-independent and phospholipid-dependent. It is not activated by phorbolesters or diacylglycerol. This kinase can be recruited to vesicle tubular clusters (VTCs) by direct interaction with the small GTPase RAB2, where this kinase phosphorylates glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPD/GAPDH) and plays a role in microtubule dynamics in the early secretory pathway. This kinase is found to be necessary for BCL-ABL-mediated resistance to drug-induced apoptosis and therefore protects leukemia cells against drug-induced apoptosis. There is a single exon pseudogene mapped on chromosome X. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
