Basic Information
Symbol
PSD3
RNA Class
mRNA
Alias
pleckstrin and Sec7 domain containing 3
KIAA0942
HCA67
EFA6R
DKFZp761K1423
EFA6D
PH and SEC7 domain-containing protein 3
ADP-ribosylation factor guanine nucleotide factor 6
epididymis tissue protein Li 20mP
exchange factor for ADP-ribosylation factor guanine nucleotide factor 6 D
exchange factor for ARF6 D
hepatocellular carcinoma-associated antigen 67
pleckstrin homology and SEC7 domain-containing protein 3
Epididymis tissue protein Li 20mP
Exchange factor for ADP-ribosylation factor guanine nucleotide factor 6 D
Exchange factor for ARF6 D
Hepatocellular carcinoma-associated antigen 67
Pleckstrin homology and SEC7 domain-containing protein 3
Location (GRCh38)
8:18527303-19084730
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_015310.4
Sequence length
11704 nt
GC Content
0.4177
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3418.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-3640.53 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
3283.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
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| NM_001412882.1 | GGCAGUCCCGGGAGCUCAACAAAGAGCACGCGGCGCUGGCCGCCGGCAC… | 11910 nt | 0.4186 |
| NM_001412883.1 | GCUGGGCUUCCUGCUGCUGCACUGGGGGACAUGGUUACAUUAAAGCUAA… | 11576 nt | 0.4140 |
| NM_001412884.1 | GUGUUGAGAGAGGAGGCUGGGAAGAGGGGGACGUCCUCCUUCAACUUCU… | 942 nt | 0.4268 |
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Summary
Predicted to enable guanyl-nucleotide exchange factor activity and phospholipid binding activity. Predicted to be involved in regulation of ARF protein signal transduction. Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in glutamatergic synapse; postsynapse; and ruffle membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
