Basic Information

Symbol
PTGS2
RNA Class
mRNA
Alias
prostaglandin-endoperoxide synthase 2 COX2 prostaglandin G/H synthase 2 cyclooxygenase 2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 (prostaglandin G/H synthase and cyclooxygenase) COX-2 GRIPGHS PGG/HS PGHS-2 PHS-2 hCox-2 PGH synthase 2 PHS II cyclooxygenase 2b prostaglandin H2 synthase 2 Prostaglandin G/H synthase 2 Cyclooxygenase-2 Prostaglandin H2 synthase 2 Prostaglandin-endoperoxide synthase 2 EC 1.14.99.1 EC 1.14.99
Location (GRCh38)
1:186671791-186680922 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_000963.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_000963.4
Sequence length
4510 nt
GC Content
0.3683

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1109.91 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1202.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1056.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_000963.4 AAUUGUCAUACGACUUGCAGUGAGCGUCAGGAGCACGUCCAGGAACUCC… 4510 nt 0.3683
Summary

Prostaglandin-endoperoxide synthase (PTGS), also known as cyclooxygenase, is the key enzyme in prostaglandin biosynthesis, and acts both as a dioxygenase and as a peroxidase. There are two isozymes of PTGS: a constitutive PTGS1 and an inducible PTGS2, which differ in their regulation of expression and tissue distribution. This gene encodes the inducible isozyme. It is regulated by specific stimulatory events, suggesting that it is responsible for the prostanoid biosynthesis involved in inflammation and mitogenesis. [provided by RefSeq, Feb 2009]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image