Basic Information
Symbol
PTK2
RNA Class
mRNA
Alias
protein tyrosine kinase 2
FAK
FADK
FAK1
PPP1R71
protein phosphatase 1, regulatory subunit 71
PTK2 protein tyrosine kinase 2
FADK 1
FRNK
p125FAK
pp125FAK
focal adhesion kinase 1
FAK-related non-kinase polypeptide
focal adhesion kinase-related nonkinase
protein phosphatase 1 regulatory subunit 71
Focal adhesion kinase 1
Focal adhesion kinase-related nonkinase
Protein phosphatase 1 regulatory subunit 71
Protein-tyrosine kinase 2
EC 2.7.10.2
EC 2.7.10
Location (GRCh38)
8:140657900-141002216
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001352702.2
Sequence length
5136 nt
GC Content
0.4511
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1488 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1586.87 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1174.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001352702.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 5136 nt | 0.4511 |
| NM_001352703.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 5162 nt | 0.4491 |
| NM_001352704.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 5115 nt | 0.4516 |
| NM_001352705.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 5277 nt | 0.4554 |
| NM_001352706.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 4963 nt | 0.4495 |
| NM_001352707.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 5078 nt | 0.4486 |
| NM_001352708.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 5021 nt | 0.4501 |
| NM_001352709.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 5052 nt | 0.4507 |
| NM_001352710.2 | AGUCCCGGGGCGGAUGCGGCGGAGACCGGCCCCUCCCGCGCCCCCGGCC… | 5019 nt | 0.4479 |
| NM_001352711.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 4960 nt | 0.4496 |
Showing 11 to 20 of 131 entries
Summary
This gene encodes a cytoplasmic protein tyrosine kinase which is found concentrated in the focal adhesions that form between cells growing in the presence of extracellular matrix constituents. The encoded protein is a member of the FAK subfamily of protein tyrosine kinases but lacks significant sequence similarity to kinases from other subfamilies. Activation of this gene may be an important early step in cell growth and intracellular signal transduction pathways triggered in response to certain neural peptides or to cell interactions with the extracellular matrix. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2017]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
