Basic Information
Symbol
PTK2
RNA Class
mRNA
Alias
protein tyrosine kinase 2
FAK
FADK
FAK1
PPP1R71
protein phosphatase 1, regulatory subunit 71
PTK2 protein tyrosine kinase 2
FADK 1
FRNK
p125FAK
pp125FAK
focal adhesion kinase 1
FAK-related non-kinase polypeptide
focal adhesion kinase-related nonkinase
protein phosphatase 1 regulatory subunit 71
Focal adhesion kinase 1
Focal adhesion kinase-related nonkinase
Protein phosphatase 1 regulatory subunit 71
Protein-tyrosine kinase 2
EC 2.7.10.2
EC 2.7.10
Location (GRCh38)
8:140657900-141002216
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001352702.2
Sequence length
5136 nt
GC Content
0.4511
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1488 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1586.87 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1174.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((..((..((((((....))))))..))..)))).....(((((((((.....(((((((((((.(((((((((.(((.(((.(((((((.((((.....)))))))))......))..))).))).))))))))).))).(((((.((((.(.....).)))).)))))((((((((((((((((...........((((.((((((..((((((.....(((...........))).))).)))..)).)))).....((((.((.((.........)))).))))...((.(((((((((((.((.((....((......((((......)))).(((((((((((((..(((....)))((.((((...(((..(.(.((((....(.((((((......))))))))))).))..)))..)))).))))))))))..)))))..((((((((((.(((....))).)))))).))))....(((((((...((((((..........)))))))))))))((..((((((((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))).(((((...((((....)))))))))..))))))).))....))..)).))))))))..))).))......)))).....))))))))))))))))...((((((.((...((((((...(((........)))...((((((((((.....(((((((((((((((((.((((..((((((...((..((........))..)).....))))))..)))).))))).....((((((..(((....)))....(((((((((.......(((((((..(((....)))))).))))........)))))))))((((......))))((((..((((((....)))))).))))))))))((......)).))))))))).....(((........))))))......))).)))))))...))))))..)).))))))......((.(((((......((((.((...(((..(((((((.(((((((...........((((((.((((.((((((((((.((.(((((.((((.(((((((.((((.((((....((.(((((((....(((((((.((((((((.(((.......)))((.(((.(((..(((((((((((..((..((((((((....((((((((((.............)))).....((.....)).((((..(((......))).)))).(((((..(.(((.....))).)..)))))........))))))...))))))))..))..)))))..(((((((((..((.(((......))).)).....))))))))).....)))))).)))))).)).......(((((......))).))((((((.........)).))))......((((.((((((..((((((((((.........)))).....(((((((((((((((...(((((...((((.((((((........))))))......((((.(((....(((.(((.((((((........))).))).))).)))..))).)))).....((((((....))))))))))..)))))..))))))))).)))))).....)))))).(((((.(((......)))..))))).......((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))....((..((((((.((.(((((((((((((((.......((((((...(((.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..))))))))..))..........((((((.(((.(...((((.(((((((((((.((((((.....(((..((.(((.(((..((.((.((((((((.((...........((((((..((..............))..))))))((((........)))))))))))(((((((....(((((((.((...((((((((((....((((....)).)).(((((.((.((((.((........)).))))...)).))))).........)))))))))).......)))))))))..(((((((....((((........))))...)))))))))))))).))).)).))..)))))).)).)))..(((.(((....))).))).(((((((......))))))).......)))))))))))).......))))).))))...).))).)))))).))))))))))(((((........))))))))))))).))))))).))))))).))((((((((((.....((((((.((.((((...(((((.((((((((((((((((((((..........(((((((.(((((...(((((((((.((.(((((((((..((....(((.(......).)))....)))))))))))(((((.(((((((((((((...(((((((.((((((((((.....(((..((....))....)))....(((((...))))).((((((.......((((((..(((((.((((((((((....(((..(((.(((............))).)))...)))))))))).(((((((.....((.......))....)))))))(((((....)))))))).))).))(((.((((((....))))))..))).......((((......((.(((.(((....))))))))......)))).))))))))))))...((((((...((((.(((((.(.(.(((.((............)).)))..).))))))))))...)))))).....))))))))))..(((((.(((........))).)))))((((((((.((((((((.((((((((((....(((((.(((((..(((.........)))((((.((((((((((((...((((.....((((((......))))))...))))....))))))...(((((.....)))))....(((..(((((((.(((.........(((......))).......(((....)))))))))))))...)))))))))))))..............((((.(((......(((((((..........))))))))))..)))).))))).)).))).......((((.(((((((..............))))))).))))..((((.(.......).))))..........))))))))))..))))........))))...))))))))...........((((((((....(((........)))))))))))....)))))))...))))))))))))))))))((((((..............)))))))))))).)))))..))))).)))))))..((((((....(((.((((..(((....)))........(((((.....))))))))))))....))))))((((((((((((...((((((.........))))))...........((((((..(((((...(((.((((((..((((((((((((((.............))).)))))))))..((((...))))...........(((((((.....(((((....)))))...)))))))))..))))))..)))...)))))..((((((((.....))))))))((((((.((((((.............(((((((..((((((.((((..(((..(((((..((.....))...)))))))).)))).))))))...)))))))............)))))).))))))...((((......)))).........))))))..((..(((((((((.((.((((...(((((((...)))))))........)))).)).)))))))))..))...))))))))))))((..((((((((.....))))))))..)).....))))))))).))))))).......)))).))...)))....)))).)).))))))....)))))))))).........(((((((...((((......(((.....)))....))))....)))))))...................))))...))))..)))))))((((.....))))...((((....(((((((((((.(((.((.((....((((.......)))))).))..))).)))))..))))))...))))......)))).))))).))))))).)))))....)))))))))).(((.((((.(((......(((((((((............))))..)))))........))))))).)))........(((((............)))))((((((.......))))))))))))).......)))))))..))).)).))))......))))).))((.((((..(((((.........((((......))))..))))))))).)).))).)))))...)))).......)))))...(((((.(((.(((((...((((((((.....((..((((...(((...(((((...)))))...(((((((...)))))))...((((.........(((((.((((........))))))))).))))...))).))))..))....)))))))).))))).)))..)))))......(((....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((..((..((((((....))))))..))..))))..{({((({,((((.....(((((((((((.(((((((((.(((,(({.({(((((.((((.....)))))))))...,..,,,.))).))).))))))))).))).(((((.((((.(.....).)))).)))))((((((((((((((((..,..,,{{..{,(({(((({{,,((({{{.,,,.,,|,,..,,,...,))),))},))),.)).}|||,,,{{(((.,{,{|{{......{{{|.{{{|,,...((.({{((({(((({{{,,,....{{{....{,((({{{.{{,,,,..||,}}}||||||.}||,......|{({(({|,..,|{,.|,,,{,,,...,{,{(((((......))))))}}})),)}.}}}}..},||{||}|||,|,,..||||},.((((((((({.(((....))).}))))).)))}{{{.,,,((((.{{((((((..,,...,,.))))))}))))))...}))(({{((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).))))}})..)))){(((((((((((((...})))))},)))).))}...{,....,,...)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))))).......{{{,....)}))))})},,,))},))))),..,})},,},)})))))),.))).}}.....,))),.,,,.))))))))))))))))...((((((.((...((((((...((,...,,,..}}}...((((((((((.,,..((({,(((({((({{((.((,{{{(((((({{.((..((,{......||..|,....,||,,,,..},,,.})))).....{((((,..(({....}}},,,.,((((({((,,,,{{{(((({((,.(((,...,}}}},,)))}.},,,},,)))))}}))||||.,,}}})))|((((..((((((....)))))).)))))))))}..}}}}..},.}}})))))),}}..|||...,},.,))})))..,,..))).)))))))...))))))..)).))))))......{(.(((((.,,...((((.((...(((..(((((((.{((((((...........((((((.((((.((((((((((.((.(((((.((((.{(({{{{.,,{{.{(((..,{((.(((((((....(((((((.(((((((((((.(,,(((((((((((.,.......,,,,,,((((((........((({...((((..((({{{{{...,|...{{||{{{....((.....))..}}}..||{.((((((((({{(((((((...,((.(({(((({{{{..,{,,,,.,...(((((((.....))))))),,||,{((,(((((((((((((..((.(((......))).)).....)))))))),...,,,|,|||{..,{{{,|,,,,,,,,{{,,{,,,,,.}}}...((((((.........)).))))...,...}}}}|||||}.,((({{{.(((.....}},.,.)),}..}||||{{(((((((((...(((((...{(((((((,{(...,,...||}|||..,{{.((((.(((....(((.{({.((((((........))).))).})}.)))..})).))))..},}||||||....},)))))))}..)))))..))))))))).|}||,|,.,,.}}}}}},}))},,)}))))}}}}.)).,)))))))}...((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).)){{,...{((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...))))}..||,,,.,,||||,||.(((((((((((((((.......((((((...(({.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..,,,))))},{{((({|{({.{{{.....))).))}.})))))},)))))))))..||((((((((.,((.((((((((.....(((((((((.((.(((...(((....)))..))).))...)))))),.})},......)))),,))).)).,...)))}}))))||(((({....(((((((.((...((((((((((....((((....)).))|(((((.{{.((((.((........)).))))...,,.))))).,.......)))))))))).......)))))))))..((((((({{..((((........))))}},)))))))))))))),)))))..}}}..))}}..})}...,.(((.(((....))).))).))))))..))),,)).)))))))))))))...(((.((((((.....(((......((((((,........},)))))).....))).......)))))))))))))).))))))).))))))).))((((((((((.....((((((.((.((((...{(({{,(({(((((((((((((((((..........(((((((.(((((...(((((((((.(((((.(({((((,...}))))}}))),{{{({{{{{{{{{||||,..,,,|||{{.(((((((((((((...(((((({.((((((((((....,(((..,,.,,|}}....,,,....{((({...)))),.(((((((.....,(((,((.(((,,(.((.(((((((....(((..{((.{{{............})},)}}...)))))))))).))))}}},,...,........,|,,,,|||,|{((((((....)))))}|}||{{{..(((.((((((....))))))..)))....,|,||{|,.....((.{((.(((....))))))))......,)))})))),)))))))...((((((...(((,,(((({,(.{.(((.((...,,.....,,)).)))..,.))))))))))...)))))).....))))))))))..(((((.{((.......,))).))))){{((((((.((((((((.((((((((((....(((((.(((((.,({{.........,||(,{.(((((((((((((...((((.{{..((((((......)))))).}}))))....))))))...(((((.....)))))..,,(((..(((((({.(((,.,,...{{{{,..,,..}}},......,||...,)))))))))))))...))))))))))})),.............{((,.{(((..{{.(((((((..........))))))).))))))}).))))).)).)))....{{,((((.(((((((.............,))))))).))))}},,{{,{.......}.}}))..........))))))))))..))))},......,))).,.}))}}}}},..........{(((((((....{{{........})))))))))}....,))))))...)))))))))))))}}))}||||||.,},,.}},..,,,}},,,.)))))).)))))..))))).)))))))..((((((....{({.((({..(((....)))..,,,,..(((((.....)))))})))}}}....)))))){(((((((((((...((((((,........}}}}}}...{{,{....((((({.,|{{{,,{,{{{.((((({..((((((((((((((.....,,....||}||.}}||})}},,|{{{,..,,))},.......,,.,,|||||}},,,|{|{|....))}))...}},,}}}}}..})))))..)))...,,,,,..((((((((.....))))))))((((((.((((((.{(,..,......(((((((..((((((.((((..(((..(((((..((.....))...)))))))).)))).))))))...))))))).........}),)))))).))))))...((({......))))..}}},...)))))}..((..(((((((((.((.((((,..(((((((...)))))))..}.....)))).)).)))))))))..))...)))))))))))){{..((((((((.....))))))))..}}.....))))))))).))))))).......)))).)}...}))....)))).)).))))))....)))))))))).........(((((((...((((...,..{{{.....}))....))))....)))))))...,||.......,,,,.,||||,..,,,,..)}}))))|,||,....}}}},,,(((({{,,((((({(((((.(((.{{,((,...((({.......))))},.}}..))).)))))..)))))}.,.}}))},,,..)))).))))).))))))).))))}....)))))))))}.,{{.,(((,,,.......(((((((((..,,....,,..))))..))))).,,....})}.,}},.....,,,,,,.||||,.,..,.,,},.,}}}}|((((((.{....}))))))))))))).......)))))))..))).)).))))...,,.))))).)}((.((((..(((((.......{,(({{....,.}}),.}))))))))).)).))).)))))...})}}......}))}}....,{{{,{((({((({{,,..((((({,,....})))))).,|||{{.{{(({{{.(((((.....(((((((...))))))).....))))}......(((((.(({(,.......))))))))),||{{..,})),)}}.},}))))})))}..,,.,,}}}......,|||,.....}|||....}}.
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001352742.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 4733 nt | 0.4469 |
| NM_001352743.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 4822 nt | 0.4469 |
| NM_001352744.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 4688 nt | 0.4469 |
| NM_001352745.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 4670 nt | 0.4469 |
| NM_001352746.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 4625 nt | 0.4471 |
| NM_001352747.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 5141 nt | 0.4449 |
| NM_001352748.2 | ACGGCCUCGAGGGCGCGAGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGUCCCG… | 1856 nt | 0.4591 |
| NM_001352749.2 | GUCAUUAUUAGAACUCUAGAGUUGUAGGAAUGUAGGAAGAGCUGUUUGC… | 2957 nt | 0.4491 |
| NM_001352750.2 | GUCAUUAUUAGAACUCUAGAGUUGUAGGAAUGUAGGAAGAGCUGUUUGC… | 2948 nt | 0.4484 |
| NM_001352751.2 | GUCAUUAUUAGAACUCUAGAGUUGUAGGAAUGUAGGAAGAGCUGUUUGC… | 2894 nt | 0.4475 |
Showing 51 to 60 of 131 entries
Summary
This gene encodes a cytoplasmic protein tyrosine kinase which is found concentrated in the focal adhesions that form between cells growing in the presence of extracellular matrix constituents. The encoded protein is a member of the FAK subfamily of protein tyrosine kinases but lacks significant sequence similarity to kinases from other subfamilies. Activation of this gene may be an important early step in cell growth and intracellular signal transduction pathways triggered in response to certain neural peptides or to cell interactions with the extracellular matrix. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2017]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
