Basic Information
Symbol
PTN
RNA Class
mRNA
Alias
pleiotrophin
HBNF
HBGF8
heparin binding growth factor 8
neurite growth-promoting factor 1
HARP
HB-GAM
HBBM
HBGF-8
HBNF-1
NEGF1
OSF-1
heparin affin regulatory protein
heparin-binding brain mitogen
heparin-binding growth factor 8
heparin-binding growth-associated molecule
heparin-binding neurite outgrowth promoting factor
heparin-binding neurite outgrowth-promoting factor 1
osteoblast-specific factor 1
pleiotrophin (heparin binding growth factor 8, neurite growth-promoting factor 1)
HBNF1
Pleiotrophin
Heparin-binding brain mitogen
Heparin-binding growth factor 8
Heparin-binding growth-associated molecule
Heparin-binding neurite outgrowth-promoting factor
Heparin-binding neurite outgrowth-promoting factor 1
Osteoblast-specific factor 1
Location (GRCh38)
7:137227341-137344358
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_002825.7
Sequence length
1482 nt
GC Content
0.4170
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-384.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-415.03 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
329.6
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001321386.2 | AAGGGGAAAUAAGGGACAAGAGAGACCCUCUCAUAUUGUUUUAUAUUAU… | 1740 nt | 0.4126 |
| NM_001321387.3 | AUUCUCCAUUUCCCUUCCGUUCCCUCCCUGUCAGGGCGUAAUUGAGUCA… | 1479 nt | 0.4165 |
| NM_002825.7 | AUUCUCCAUUUCCCUUCCGUUCCCUCCCUGUCAGGGCGUAAUUGAGUCA… | 1482 nt | 0.4170 |
Summary
The protein encoded by this gene is a secreted heparin-binding growth factor. The protein has significant roles in cell growth and survival, cell migration, angiogenesis and tumorigenesis. Alternative splicing and the use of alternative promoters results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2016]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
