Basic Information
Symbol
PTPLAD1
RNA Class
mRNA
Alias
3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3
B-ind1
HSPC121
Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3
protein tyrosine phosphatase-like A domain containing 1
BIND1
PTPLAD1
butyrate-induced protein 1
butyrate-induced transcript 1
protein tyrosine phosphatase-like protein PTPLAD1
protein-tyrosine phosphatase-like A domain-containing protein 1
very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-[acyl-carrier protein] dehydratase 3
Butyrate-induced protein 1
hB-ind1
Protein-tyrosine phosphatase-like A domain-containing protein 1
EC 4.2.1.134
Location (GRCh38)
15:65530418-65578349
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_016395.4
Sequence length
3228 nt
GC Content
0.4238
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-939.85 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-996.88 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
843.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
Enables enzyme binding activity and very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase activity. Involved in fatty acid biosynthetic process; positive regulation by virus of viral protein levels in host cell; and positive regulation of viral genome replication. Located in endoplasmic reticulum and nuclear membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
