Basic Information

Symbol
PYCR2
RNA Class
mRNA
Alias
pyrroline-5-carboxylate reductase 2 P5CR2 pyrroline-5-carboxylate reductase family member 2 HLD10 P5C reductase 2 Pyrroline-5-carboxylate reductase 2 P5CR 2 EC 1.5.1.2
Location (GRCh38)
1:225919397-225924340 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001271681.2
BLAST PRIMER
NM_013328.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_013328.4
Sequence length
1680 nt
GC Content
0.5708

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-656 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -684.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 585.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001271681.2 AUCCCAGAAGCUGCUGUUAGCUCGCCGGUCCUCGGCACGCCGCCCGUUC… 1458 nt 0.5638
NM_013328.4 AUCCCAGAAGCUGCUGUUAGCUCGCCGGUCCUCGGCACGCCGCCCGUUC… 1680 nt 0.5708
Summary

This gene belongs to the pyrroline-5-carboxylate reductase family. The encoded mitochondrial protein catalyzes the conversion of pyrroline-5-carboxylate to proline, which is the last step in proline biosynthesis. Alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2012]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image