Basic Information
Symbol
RAPGEF2
RNA Class
mRNA
Alias
Rap guanine nucleotide exchange factor 2
PDZ-GEF1
RA-GEF
DKFZP586O1422
KIAA0313
Rap GEP
PDZ domain containing guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1
Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2
CNrasGEF
NRAPGEP
PDZGEF1
RA-GEF-1
RAGEF
Rap-GEP
nRap GEP
PDZ domain-containing guanine nucleotide exchange factor 1
RA(Ras/Rap1A-associating)-GEF
cyclic nucleotide ras GEF
neural RAP guanine nucleotide exchange protein
ras/Rap1-associating GEF-1
Cyclic nucleotide ras GEF
Neural RAP guanine nucleotide exchange protein
Ras/Rap1-associating GEF-1
Location (GRCh38)
4:159103013-159360174
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001394067.2
Sequence length
8101 nt
GC Content
0.4798
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2660.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2815.58 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1705.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
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Summary
Members of the RAS (see HRAS; MIM 190020) subfamily of GTPases function in signal transduction as GTP/GDP-regulated switches that cycle between inactive GDP- and active GTP-bound states. Guanine nucleotide exchange factors (GEFs), such as RAPGEF2, serve as RAS activators by promoting acquisition of GTP to maintain the active GTP-bound state and are the key link between cell surface receptors and RAS activation (Rebhun et al., 2000 [PubMed 10934204]).[supplied by OMIM, Mar 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
