Basic Information
Symbol
RBM23
RNA Class
mRNA
Alias
RNA binding motif protein 23
FLJ10482
CAPERbeta
coactivator of activating protein-1 and estrogen receptors beta
RNA-binding region (RNP1, RRM) containing 4
PP239
RNPC4
probable RNA-binding protein 23
CAPER beta
RNA-binding region-containing protein 4
coactivator of activating protein-1 and estrogen recep- tors beta
splicing factor SF2
Probable RNA-binding protein 23
RNA-binding motif protein 23
Splicing factor SF2
Location (GRCh38)
14:22893204-22919182
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001077351.2
Sequence length
10007 nt
GC Content
0.4701
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3442.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-3623.82 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
2410.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
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Summary
This gene encodes a member of the U2AF-like family of RNA binding proteins. This protein interacts with some steroid nuclear receptors, localizes to the promoter of a steroid- responsive gene, and increases transcription of steroid-responsive transcriptional reporters in a hormone-dependent manner. It is also implicated in the steroid receptor-dependent regulation of alternative splicing. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
