Basic Information

Symbol
RBM23
RNA Class
mRNA
Alias
RNA binding motif protein 23 FLJ10482 CAPERbeta coactivator of activating protein-1 and estrogen receptors beta RNA-binding region (RNP1, RRM) containing 4 PP239 RNPC4 probable RNA-binding protein 23 CAPER beta RNA-binding region-containing protein 4 coactivator of activating protein-1 and estrogen recep- tors beta splicing factor SF2 Probable RNA-binding protein 23 RNA-binding motif protein 23 Splicing factor SF2

Secondary Structure

MANE Select
NM_001077351.2
Sequence length
10007 nt
GC Content
0.4701

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3442.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -3623.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2410.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

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NM_001352765.2 AGAGCUGCCGCCAUUUUGCGGGAAGAGGAGGCUCUGUACCUGCAGUGCU… 10099 nt 0.4712
NM_001352766.2 AGAGCUGCCGCCAUUUUGCGGGAAGAGGAGGCUCUGUACCUGCAGUGCU… 10244 nt 0.4725
NM_018107.5 AGAGCUGCCGCCAUUUUGCGGGAAGAGGAGGCUCUGUACCUGCAGUGCU… 9959 nt 0.4700
Summary

This gene encodes a member of the U2AF-like family of RNA binding proteins. This protein interacts with some steroid nuclear receptors, localizes to the promoter of a steroid- responsive gene, and increases transcription of steroid-responsive transcriptional reporters in a hormone-dependent manner. It is also implicated in the steroid receptor-dependent regulation of alternative splicing. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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