Basic Information

Symbol
RFK
RNA Class
mRNA
Alias
riboflavin kinase FLJ11149 RIFK 0610038L10Rik ATP:riboflavin 5'-phosphotransferase flavokinase Riboflavin kinase Flavokinase EC 2.7.1.26
Location (GRCh38)
9:76385526-76394517 UCSC Genome Browser

Secondary Structure

MANE Select
NM_018339.6
Sequence length
2596 nt
GC Content
0.3740

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-704.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -761.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 726.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........(((.((((((((((.....))))))))))(((((((....(((((((((............(((((((((((((...(((.(((((....))))))))))))))).)))))).(((.((((....)))).)))(((((((....))).)))).((((((.....)))))).)))))))))(((((....(((....)))..)))))((.((((((((((.(((((...(((((.(((((..(.....((((((....))))))).))))))))))............))))).))))).))).))...))...((((((((.((((..(((((...(((((.((..(((((((((.....((((.((.......))))))))))))))))).))))).....)))))..)))).)))))))).(((((((((.((((((.(((((....(((((...............(((((((((((......))))..........(((....)))))))))))))))...)))))....(((((((....)))))))(((....))).............((((((((.(((((((..............))))))).))))))))((..((((((.(((((((..(((......(((((...)))))(((((.....)))))..)))..))......((((((.(((((((....(((((........))))).....))))))).)))))))))))))))))..)).......)))))).)))))))))((((.((.(((((...((((((...........))).))).))))).))))))((((((((..(((((.((((.((((((.............))))..)).)))).)))))(((..(((((.(((.(..((((((((((((........((((((......)))))).(((((.(.(((((((((((((.....(((((..((......))..)).)))........(((((((......)))))))((((...)))).))))))).)))))).).)))))....(((((......)))))((((....)))).(((((((...(((((.......)))))(((..((((..((((((....)))))).))))..)))((((..(((((((.(((((((.(((...)))))...)))))..)).)))))..))))......................((((((((..((((((((((((...(((((........((....))....)))))..)))))))))))).)).))))))))))))).......(((((((((....)))))))))))))))))))))).)))...)))))..))).....))))))))..................))))))).........((((((...)))))).....))).....((((((((((.((((((((((((.(......).))))))))............(((........))).(((((((((..........)).)))))))..((((....))))................(((((((.....)))))))))))))))))))))...((((((((......((((((((((.(((((....)))))..........((((((((..........((((........))))......)))))))).............(((((((((....))))))))).....((((((((((.((((..((((((..((((.((((.(((((((((((........)))))((.((.(((((..((((((....((((...((((.......))))...))))))))))))))).))..)).(((((((((....)))((((((..........))))))....(((((...((((((....((((((...(((((((((((((((((((....))))))))....(((((((((((((((..((((.(((((.((((.(((((((((((((........((((((...(((((.((.(((((.((.(((..((........(((((((....))))))).......(((((.(((.....))).)))))...........)).))))).)))))..)).))))).....))))))........))))))))))))))))).(((((((.(((.....))))))))))..........((((........)))).))))).........(((((((((...)))))))))((((((((((((...(((((....)))))))))))))))))))))..)))..))))))))))))(((((...((((.(((((((((..(..(((....)))..)..)))))))))))))....))))).......(((((...)))))..))))))))))).))))))....))))))..))))).....((((((((((........))).)))))))))))))...)))))).)))).)))))))))))))))))))))))).))))))))))))))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((({.((({((((((((((.....)))))))))}}}}|||,....({{((((((((,...,}))))))}|{({((,(((,(((({{(({,({((((|||(((({({{.||,||}||},|{|,|||{|,.,||||{|}{(((((((....)))}})))}((((((.....)))))),{{{{(,(((((,.,....))))).}))).))})))|).}}}||||||||.({(({(((((((.(((((..|.....((((((....)))))),.))))))))))...})))).))||||||.},))}})))}}}}{((((((((((((((.((((..(((((...(((((.(,.{(((((((((.....((((.{(,....,,}}))))))))))))))}.)))))...,.)))))..)))).)))))))..(((((((((.((((((.{((((,,..{{{{{...............(((((({((((,.....}}}....,......|||,...|||}}}}}}}}}}}),..}))))}...(((((((....))))))){{(,...|}}........,,,,.,{((((({.(((((({..............})))))).))))))}|((..((((((.{((((({,,..,,,,...{((({...|}}}}(((((.....)))))..}||||,...,,}}.,{{{{.{(((((|....,(((({,.,,,..,,}})}},.,))))))).)))})))))))))))))..))},.....)))))).)))))))))((((.{{.(((((...{{{,,{.,{.......,}},,))).))))).}}))))((((((((.((({{{.{{{{.,{((({.............}}||,,,,.}}}}.|}}||{({..,,{{{,((({((.,,,,,,,||||}},........,,,{......|||{((((((((.{.(((((((((((((,,,,.{{{{{..{{......}}..}}.}}|.,,,,...{{{{{{{......})))))}((({...)))),))))))).)))))).}.))))).))}|((((......))))|((((....}}}}.,{{||{|,..||||{,,,}}.,))}||(((..((((..((((({....}))))).))))..)))||((,.(((((((,((({{.,,|||,,,}.,,},}})))))..,,.}))||..}}}}.}}}}..............,{{(((((({{|,((((((((((((...(((((.{{.....((....)),,..)))))..)))))))))))}.,,.},,,,}|}|}},}...||.{(((((((((....)))))))))),)),})))})))}))),,,))))),.}}}.,}}.))))))))....,.,,....,},..,,)))))))}.......||||||.,,))))},,,}}}))},....((((((((((.{(((((((((((.(......).)))))))),...........,,{....,,..|||,(((((((,,,,........)).))))))}..|||},..}))||........,,.....,(((((((.....))))))))))}))))))))))...,.,{{{|||{,,..{{{|||||||,|{||,....,}}}}..........{((({{{{||{,,.....||||,.......|},,...,,,|||}}}}|.......,,||,,,||||||||..,,||}}},))}},...((((((((({{((((..((((((..((((.((((.{((((((((((........)))))...(({,,,,..||{{...,}}}}.,|{{{(,,((((((..,{{{.,,,.,,,}}}}},......)))))),,||||(((....)))((((((..........))))))....{((({.,.((((((..,.{(((((,{.(((((((((((((((((((....)))))))).......,|.((((((({((({,,.((((((((((((({,..{{(.(((((((.,{,.,,.((((({{((((.{,.,,{{{{(({..({{.(,.....{.{(((((....,||||,,,.......(((((.(((.....))).)))))..,|,,,,,,.,},}})),}))}})}})).))))))))))},)}))))))).)))))))))))))))))...{{((((,.(((.....)))}}))))}.....,,,,.{({{........}}}}..)))).})))))).{((((((((...))))))))}{(((((((((((,..{((((....))))))))))))))))|((((((.,..{{{,..((..{,,(((((...((((.(((((((((..{..{((,...,}}..)..)))))))))))))....))))).,}}))....}}}..))))))})))))))))))})))))).,..)))))).,))))}.....{(((((((((........)))))))))))}},,,,...)))))}.)))).)))))))))))))))))))))))).}}}}}}}))},.))))))..

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_018339.6 ACUUACUUCGGCUGUCUCCGCUGCCCUCCAGCGGAGACGCAGCUCCUCA… 2596 nt 0.3740
Summary

Riboflavin kinase (RFK; EC 2.7.1.26) is an essential enzyme that catalyzes the phosphorylation of riboflavin (vitamin B2) to form flavin mononucleotide (FMN), an obligatory step in vitamin B2 utilization and flavin cofactor synthesis (Karthikeyan et al., 2003 [PubMed 12623014]).[supplied by OMIM, Nov 2009]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image