Basic Information

Symbol
RNASEH2B
RNA Class
mRNA
Alias
ribonuclease H2 subunit B FLJ11712 deleted in lymphocytic leukemia 8 Aicardi-Goutieres syndrome 2 ribonuclease H2, subunit B AGS2 DLEU8 Aicardi-Goutieres syndrome 2 protein RNase H2 subunit B ribonuclease HI subunit B Ribonuclease H2 subunit B Deleted in lymphocytic leukemia 8 Ribonuclease HI subunit B
Location (GRCh38)
13:50909747-51024120 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001142279.2
BLAST PRIMER
NM_001411023.1
BLAST PRIMER
NM_024570.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_024570.4
Sequence length
1513 nt
GC Content
0.4389

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-431.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -463.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 368.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001142279.2 CCGCUGGCUAGACCAUGGAGGGCCGCUGGGUGCAGCCACAGAGCGCGGG… 1685 nt 0.4932
NM_001411023.1 ACUAGCGGAGCCGCGAGGGAGAGGCCGCGGCCCCUUCCCGUUGCCUGCG… 1583 nt 0.4769
NM_024570.4 ACUAGCGGAGCCGCGAGGGAGAGGCCGCGGCCCCUUCCCGUUGCCUGCG… 1513 nt 0.4389
Summary

RNase H2 is composed of a single catalytic subunit (A) and two non-catalytic subunits (B and C) and specifically degrades the RNA of RNA:DNA hybrids. The protein encoded by this gene is the non-catalytic B subunit of RNase H2, which is thought to play a role in DNA replication. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. Defects in this gene are a cause of Aicardi-Goutieres syndrome type 2 (AGS2). [provided by RefSeq, Nov 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image