Basic Information

Symbol
RNASEH2C
RNA Class
mRNA
Alias
ribonuclease H2 subunit C AYP1 AGS3 Aicardi-Goutieres syndrome 3 ribonuclease H2, subunit C RNase H1 small subunit RNase H2 subunit C aicardi-Goutieres syndrome 3 protein ribonuclease HI subunit C Ribonuclease H2 subunit C Aicardi-Goutieres syndrome 3 protein Ribonuclease HI subunit C
Location (GRCh38)
11:65714005-65720818 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_032193.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_032193.4
Sequence length
2645 nt
GC Content
0.5747

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1078.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1123.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 522.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_032193.4 AGUGUCAGCUCGCGAGCCCUGGCGUCGCGUAGGAGGGAGGAUGGAGAGC… 2645 nt 0.5747
Summary

This gene encodes a ribonuclease H subunit that can cleave ribonucleotides from RNA:DNA duplexes. Mutations in this gene cause Aicardi-Goutieres syndrome-3, a disease that causes severe neurologic dysfunction. A pseudogene for this gene has been identified on chromosome Y, near the sex determining region Y (SRY) gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image