Basic Information
Symbol
ATF3
RNA Class
mRNA
Alias
activating transcription factor 3
cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3
cAMP-dependent transcription factor ATF-3
Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3
Activating transcription factor 3
Location (GRCh38)
1:212565334-212620777
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001674.4
Sequence length
1940 nt
GC Content
0.5041
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-651.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-686.61 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
323.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001030287.4 | GUGACAAGAAGAGAAAUCCUCCUCUAUAUAGGAUGCUCUGCUGUUUCCU… | 1847 nt | 0.4775 |
| NM_001040619.3 | ACAGUCGCACGCAGCCAGGCGCGCACUGCACAGCUCUCUUCUCUCGCCG… | 2252 nt | 0.5133 |
| NM_001206484.3 | ACAGUCGCACGCAGCCAGGCGCGCACUGCACAGCUCUCUUCUCUCGCCG… | 1900 nt | 0.5021 |
| NM_001206485.1 | CGGGAAGCUAUUAAUAGCAUUACGUCAGCCUGGGACUGGCAACACGGAG… | 3187 nt | 0.5067 |
| NM_001206486.2 | CAAAAUGAUGCUUCAACACCCAGGCCAGGUCUCUGCCUCGGAAGAAGAG… | 2010 nt | 0.4871 |
| NM_001206488.3 | ACAGUCGCACGCAGCCAGGCGCGCACUGCACAGCUCUCUUCUCUCGCCG… | 1917 nt | 0.5050 |
| NM_001674.4 | ACAGUCGCACGCAGCCAGGCGCGCACUGCACAGCUCUCUUCUCUCGCCG… | 1940 nt | 0.5041 |
| NM_004024.4 | CGGGAAGCUAUUAAUAGCAUUACGUCAGCCUGGGACUGGCAACACGGAG… | 2270 nt | 0.5110 |
Summary
This gene encodes a member of the mammalian activation transcription factor/cAMP responsive element-binding (CREB) protein family of transcription factors. This gene is induced by a variety of signals, including many of those encountered by cancer cells, and is involved in the complex process of cellular stress response. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. It is possible that alternative splicing of this gene may be physiologically important in the regulation of target genes. [provided by RefSeq, Apr 2011]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
