Basic Information
Symbol
RNF10
RNA Class
mRNA
Alias
ring finger protein 10
KIAA0262
RIE2
E3 ubiquitin-protein ligase RNF10
epididymis secretory sperm binding protein
RING finger protein 10
EC 2.3.2.27
Location (GRCh38)
12:120533480-120577588
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_014868.5
Sequence length
3814 nt
GC Content
0.5236
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1340.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1411.65 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1043.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001330474.2 | GCUGUUUGGCGACUCGUCGCCAUUCCCGGAGCAGGUCGGCCUCGGCCCA… | 3829 nt | 0.5234 |
| NM_014868.5 | GCUGUUUGGCGACUCGUCGCCAUUCCCGGAGCAGGUCGGCCUCGGCCCA… | 3814 nt | 0.5236 |
Summary
The protein encoded by this gene contains a ring finger motif, which is known to be involved in protein-protein interactions. The specific function of this protein has not yet been determined. EST data suggests the existence of multiple alternatively spliced transcript variants, however, their full length nature is not known. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
