Basic Information

Symbol
RNF169
RNA Class
mRNA
Alias
ring finger protein 169 KIAA1991 E3 ubiquitin-protein ligase RNF169 RING-type E3 ubiquitin transferase RNF169 RING finger protein 169 EC 2.3.2.27 EC 3.4.24.57 EC 3.1.4.16
Location (GRCh38)
11:74748849-74842413 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001098638.2
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001098638.2
Sequence length
7842 nt
GC Content
0.4447

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2446.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2595.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2170.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001098638.2 GCAACCGACUCUCCCUUCAAACGGGAAACAAGAUGGCGGCUGCAGGUCC… 7842 nt 0.4447
Summary

Enables K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding activity; nucleosome binding activity; and ubiquitin-modified histone reader activity. Involved in double-strand break repair via homologous recombination and negative regulation of double-strand break repair. Located in cytosol; nuclear lumen; and site of double-strand break. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image