Basic Information
Symbol
RNF20
RNA Class
mRNA
Alias
ring finger protein 20
FLJ20382
FLJ11189
KAIA2779
BRE1A
hBRE1
BRE1
BRE1 E3 ubiquitin ligase homolog (S. cerevisiae)
E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A
BRE1 E3 ubiquitin ligase homolog
RING-type E3 ubiquitin transferase BRE1A
homolog of S. cerevisiae BRE1
BRE1-A
RING finger protein 20
EC 2.3.2.27
EC 6.3.2
Location (GRCh38)
9:101533853-101563344
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_019592.7
Sequence length
3938 nt
GC Content
0.4533
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1165.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1242.62 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
874.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_019592.7 | AAGUUCUGCCUUGUCUCCGCCGCGGGUCAGGGGUGAGAGCUGGAAUCUC… | 3938 nt | 0.4533 |
Summary
The protein encoded by this gene shares similarity with BRE1 of S. cerevisiae. The protein encoded by this human gene is an E3 ubiquitin ligase that regulates chromosome structure by monoubiquitinating histone H2B. This protein acts as a putative tumor suppressor and positively regulates the p53 tumor suppressor as well as numerous histone H2A and H2B genes. In contrast, this protein also suppresses the expression of several protooncogenes and growth-related genes, including many genes that are induced by epidermal growth factor. This gene selectively suppresses the expression of some genes by interfering with chromatin recruitment of transcription elongation factor SII (TFIIS). [provided by RefSeq, Feb 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
