Basic Information
Symbol
ROBO2
RNA Class
mRNA
Alias
roundabout guidance receptor 2
KIAA1568
roundabout (axon guidance receptor, Drosophila) homolog 2
roundabout, axon guidance receptor, homolog 2 (Drosophila)
SAX3
roundabout homolog 2
roundabout, axon guidance receptor, homolog 2
Roundabout homolog 2
Location (GRCh38)
3:75906695-77649964
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001395656.1
Sequence length
9018 nt
GC Content
0.4210
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2501.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2674.14 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
2186.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
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| NM_001378200.1 | AGUAGCACGGGCAGCUCGCGCGCUGGAGGAGGGAGGCGGAAGGACAGCG… | 8405 nt | 0.4251 |
| NM_001378201.1 | AGUAGCACGGGCAGCUCGCGCGCUGGAGGAGGGAGGCGGAAGGACAGCG… | 8396 nt | 0.4253 |
| NM_001378202.1 | CGUAGGAGUUCGGAUUCUCCACCCGAAUCGUCCUGAUUUCCCUUCUCCU… | 8736 nt | 0.4183 |
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| NM_001394213.1 | AUUAGGAUCACACAGGCAGCCUGAAAGCUGUCAGUACAACUGCUUCUCA… | 8661 nt | 0.4169 |
Showing 11 to 20 of 24 entries
Summary
The protein encoded by this gene belongs to the ROBO family, part of the immunoglobulin superfamily of proteins that are highly conserved from fly to human. The encoded protein is a transmembrane receptor for the slit homolog 2 protein and functions in axon guidance and cell migration. Mutations in this gene are associated with vesicoureteral reflux, characterized by the backward flow of urine from the bladder into the ureters or the kidney. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2014]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
