Basic Information
Symbol
ATG4C
RNA Class
mRNA
Alias
autophagy related 4C cysteine peptidase
FLJ14867
AUTL3
AUT (S. cerevisiae)-like 1, cysteine endopeptidase; AUT-like 1, cysteine endopeptidase (S. cerevisiae)
APG4 autophagy 4 homolog C (S. cerevisiae)
ATG4 autophagy related 4 homolog C (S. cerevisiae)
autophagy related 4C, cysteine peptidase
APG4-C
APG4C
AUTL1
HsAPG4C
cysteine protease ATG4C
APG4 autophagy 4 homolog C
ATG4 autophagy related 4 homolog C
AUT-like 1, cysteine endopeptidase
AUT-like 3 cysteine endopeptidase
autophagin-3
autophagy-related cysteine endopeptidase 3
autophagy-related protein 4 homolog C
epididymis secretory sperm binding protein
Cysteine protease ATG4C
Autophagy-related cysteine endopeptidase 3
Autophagin-3
Autophagy-related protein 4 homolog C
EC 3.4.22.-
EC 3.4.22
Location (GRCh38)
1:62783821-62865999
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_032852.4
Sequence length
2944 nt
GC Content
0.3471
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-708.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-769.37 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
872.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_032852.4 | AAAGUACCUGUAGCUGCGGCGCUGAGGUCGGAACGUCUGCGUGUGUGCG… | 2944 nt | 0.3471 |
| NM_178221.3 | AAAGUACCUGUAGCUGCGGCGCUGAGGUCGGAACGUCUGCGUGUGUGCG… | 2896 nt | 0.3450 |
Summary
Autophagy is the process by which endogenous proteins and damaged organelles are destroyed intracellularly. Autophagy is postulated to be essential for cell homeostasis and cell remodeling during differentiation, metamorphosis, non-apoptotic cell death, and aging. Reduced levels of autophagy have been described in some malignant tumors, and a role for autophagy in controlling the unregulated cell growth linked to cancer has been proposed. This gene encodes a member of the autophagin protein family. The encoded protein is also designated as a member of the C-54 family of cysteine proteases. Alternate transcriptional splice variants, encoding the same protein, have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
