Basic Information

Symbol
RPS4Y1
RNA Class
mRNA
Alias
ribosomal protein S4 Y-linked 1 MGC5070 MGC119100 S4 ribosomal protein S4Y 40S ribosomal protein S4, Y ribosomal protein S4, Y-linked RPS4Y small ribosomal subunit protein eS4, Y isoform 1 small ribosomal subunit protein eS4, Y small ribosomal subunit protein eS4 Small ribosomal subunit protein eS4, Y isoform 1 40S ribosomal protein S4
Location (GRCh38)
Y:2841602-2932000 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001008.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001008.4
Sequence length
1189 nt
GC Content
0.4550

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-361.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -383.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 253.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001008.4 CUCUUCCGUCGCAGAGUUUCGCCAUGGCCCGGGGCCCCAAGAAGCACUU… 1189 nt 0.4550
Summary

Cytoplasmic ribosomes, organelles that catalyze protein synthesis, consist of a small 40S subunit and a large 60S subunit. Together these subunits are composed of 4 RNA species and approximately 80 structurally distinct proteins. This gene encodes ribosomal protein S4, a component of the 40S subunit. Ribosomal protein S4 is the only ribosomal protein known to be encoded by more than one gene, namely this gene and ribosomal protein S4, X-linked (RPS4X). The 2 isoforms encoded by these genes are not identical, but are functionally equivalent. Ribosomal protein S4 belongs to the S4E family of ribosomal proteins. It has been suggested that haploinsufficiency of the ribosomal protein S4 genes plays a role in Turner syndrome; however, this hypothesis is controversial. As is typical for genes encoding ribosomal proteins, there are multiple processed pseudogenes of this gene dispersed through the genome. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image