Basic Information
Symbol
RPS4Y2
RNA Class
mRNA
Alias
ribosomal protein S4 Y-linked 2
ribosomal protein S4, Y-linked 2 pseudogene
RPS4Y2P
small ribosomal subunit protein eS4, Y isoform 2
40S ribosomal protein S4, Y
small ribosomal subunit protein eS4
small ribosomal subunit protein eS4, Y
Small ribosomal subunit protein eS4, Y isoform 2
40S ribosomal protein S4, Y isoform 2
Location (GRCh38)
Y:20756108-20781032
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001039567.3
Sequence length
848 nt
GC Content
0.4764
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-263.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-277.89 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
187.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001039567.3 | GCAGAUUACGGUUGCACCGUAAAAGGAGAGGUUCUGUUCCGUCGCGGGA… | 848 nt | 0.4764 |
| NM_138963.1 | AUGGCCCGGGGCCCCAAGAAGCACUUGAAGCGUGUUGCAGCGCCGAAGC… | 792 nt | 0.4710 |
Summary
The protein encoded by this gene is a ribosomal protein that is highly similar to RPS4Y1. This gene is located in the male-specific region of the Y chromosome. [provided by RefSeq, Aug 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
