Basic Information
Symbol
ATL1
RNA Class
mRNA
Alias
atlastin GTPase 1
FSP1
AD-FSP
atlastin
spastic paraplegia 3A (autosomal dominant)
GBP3
HSN1D
SPG3
SPG3A
atlastin1
atlastin-1
GBP-3
GTP-binding protein 3
brain-specific GTP-binding protein
guanine nucleotide-binding protein 3
guanylate-binding protein 3
hGBP3
spastic paraplegia 3 protein A
Atlastin-1
Brain-specific GTP-binding protein
Guanine nucleotide-binding protein 3
Spastic paraplegia 3 protein A
EC 3.6.5.-
Location (GRCh38)
14:50532509-50634017
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_015915.5
Sequence length
2504 nt
GC Content
0.4030
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-657.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-704.62 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
743.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001127713.1 | AGUUUGAGGCUGCACUGCACACCUGCACAACCUGCCUUCUACUUAGUUC… | 2821 nt | 0.4098 |
| NM_015915.5 | AGAGUCUGAGCGAACUGCGCCCAGCGCGGGCACGGAGCCUCCCACCGCC… | 2504 nt | 0.4030 |
| NM_181598.4 | AGAGUCUGAGCGAACUGCGCCCAGCGCGGGCACGGAGCCUCCCACCGCC… | 2512 nt | 0.4017 |
Summary
The protein encoded by this gene is a GTPase and a Golgi body transmembrane protein. The encoded protein can form a homotetramer and has been shown to interact with spastin and with mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4. This protein may be involved in axonal maintenance as evidenced by the fact that defects in this gene are a cause of spastic paraplegia type 3. Three transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
