Basic Information
Symbol
SCAPER
RNA Class
mRNA
Alias
S-phase cyclin A associated protein in the ER
Zfp291
zinc finger protein 291
IDDRP
MSTP063
ZNF291
S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum
KIAA1454
S phase cyclin A-associated protein in the ER
Zinc finger protein 291
Location (GRCh38)
15:76347904-76905970
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_020843.4
Sequence length
5033 nt
GC Content
0.4218
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1341.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1431.51 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1055.3
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001145923.2 | ACUUCUCCUUCCUGCUGCCUUGUAAAGAAGGCGCCUUGCUUGCCCUUCU… | 5134 nt | 0.4225 |
| NM_001353009.2 | GGGACGCUUUGAGCCGCCCCGAACUAAGCAGGGCGGUCGGGGCUCUGCC… | 5229 nt | 0.4284 |
| NM_001353010.2 | GGGACGCUUUGAGCCGCCCCGAACUAAGCAGGGCGGUCGGGGGUGAGUG… | 5194 nt | 0.4284 |
| NM_001353011.2 | GGGACGCUUUGAGCCGCCCCGAACUAAGCAGGGCGGUCGGGGGAGUCAU… | 5169 nt | 0.4246 |
| NM_001353012.2 | GGGACGCUUUGAGCCGCCCCGAACUAAGCAGGGCGGUCGGGGGAGUCAU… | 5121 nt | 0.4212 |
| NM_020843.4 | GGGACGCUUUGAGCCGCCCCGAACUAAGCAGGGCGGUCGGGGGAGUCAU… | 5033 nt | 0.4218 |
Summary
Predicted to enable nucleic acid binding activity and zinc ion binding activity. Acts upstream of or within retina development in camera-type eye. Located in cytosol and nuclear speck. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
