Basic Information
Symbol
SERPINB13
RNA Class
mRNA
Alias
serpin family B member 13
HUR7
hurpin
headpin
serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 13
serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 13
HSHUR7SEQ
PI13
serpin B13
PI-13
UV-B repressed sequence, HUR 7
haCaT UV-repressible serpin
peptidase inhibitor 13
protease inhibitor 13 (hurpin, headpin)
proteinase inhibitor 13
Serpin B13
HaCaT UV-repressible serpin
Hurpin
Headpin
Peptidase inhibitor 13
Proteinase inhibitor 13
Location (GRCh38)
18:63586989-63604639
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_012397.4
Sequence length
3130 nt
GC Content
0.3792
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-747.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-815.5 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
844.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001307923.2 | ACUGCUGAAGCAGAUGUGGAGAACUAUAAAUUAAGGAUCCCAGCUACUU… | 3157 nt | 0.3792 |
| NM_001348267.2 | ACUGCUGAAGCAGAUGUGGAGAACUAUAAAUUAAGGAUCCCAGCUACUU… | 3123 nt | 0.3894 |
| NM_001348268.2 | ACUGCUGAAGCAGAUGUGGAGAACUAUAAAUUAAGGAUCCCAGCUACUU… | 3340 nt | 0.3850 |
| NM_001348269.2 | ACUGCUGAAGCAGAUGUGGAGAACUAUAAAUUAAGGAUCCCAGCUACUU… | 2883 nt | 0.3833 |
| NM_001348270.2 | ACUGCUGAAGCAGAUGUGGAGAACUAUAAAUUAAGGAUCCCAGCUACUU… | 2910 nt | 0.3832 |
| NM_012397.4 | ACUGCUGAAGCAGAUGUGGAGAACUAUAAAUUAAGGAUCCCAGCUACUU… | 3130 nt | 0.3792 |
Summary
The protein encoded by this gene is a member of the serpin family of serine protease inhibitors. The encoded protein inhibits the activity of cathepsin K and is itself transcriptionally repressed by RUNX1. This gene is downregulated in many types of cancer. [provided by RefSeq, Jan 2017]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
