Basic Information
Symbol
SFRP2
RNA Class
mRNA
Alias
secreted frizzled related protein 2
SARP1
SDF-5
FRP-2
secreted frizzled-related protein 2
SARP-1
sFRP-2
secreted apoptosis related protein 1
testicular tissue protein Li 170
FRP2
Secreted frizzled-related protein 2
Secreted apoptosis-related protein 1
Location (GRCh38)
4:153780591-153789083
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_003013.3
Sequence length
1996 nt
GC Content
0.5165
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-628.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-667.52 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
460.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((........)))....((((.(((((((((((((.(((((..((((((((((.((((...(((((((.......)))))))...)))))))...(((......)))...(((((...))))).)))))))..))))).)))..((((.....))))((.(((((((((.((((..((..(((............)))..)))))).))).)))))).))((((..(.(((((((.....)))).))).)..))))(((((.(((..((.(.(((.((........))...)))).)).))).))))).((((((((((((...((.....))..))))))...((((((.....(((((..(((((((((......((((......)))).((.(((((((((((((...((((.....((((((.....((((((.((((.....(((((.(..(((((((((((......))))))))....)))..))))))..((((.((((.(((..((((........))))..)))..)))))))))))).((((......))))((.((((((((..(((......)))...)))).)))).))))))))...)).))))(((((.(.((.((((((.(((...((...))...)))..)))))))).).)))))..(((((((..((((...((((((((((......(((((((.((((.((.....)))))).)))....))))......))))))).)))....)))).................(((.......)))...)))))))..........(((((((((((((.........)))).(((......)))..(((......)))..))))))))).))))(.(((...(((..............)))....))).)((((.....)))).........))))))))))))).))......)))))))))....)))))))))))(((......))).))))))..))))))....))))))))(((((((((.(((((((((((((((....)))).((....))...((((((((((((((((.(((((((.((...(((((........))))))))))..(((((((......(((((.((.....((((((((....)))).)))))))))))......)))))))..(((((.(((...((((((((((.....((((((.((((.......))))))))))............((((((...(((.......)))..(((((.(((....)))..)))))((((...(((.(((((.......)))))))))))).......(((((((((((((((..............))))))))))))))).((((((((.(((((........))))).))))))))..)))))).)))).))))))..)))..)))))..((((((((((.(((..(((((.....(((........))))))))))).)))).)))))).)))).))))))))))))((((((......)))))).....))))((((((((((((....)).))))))))))....)))))))))))(((((.((((.....)))).)))))((((((................((......))(((..((((((((((..(((((.(((....(((((((((.((((.........))))...................((.(((.....))).)).....(((((((....................(((((((.(((((((...)))))))........))))))))))))))...........)))))))))....))).)))))..))))))))))..)))....)))))).(((((((((.............)).)))))))....((((..((((((......))))))..))))))))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((........)))....((((.(((((((((((((.(((((..((((((({(({((((,..(((((((.......)))))))...}}|||||...{((......))),..{{(({...))))).})))))}..))))).)))}.((((.....))))((.(((((((((,((({..{(..{{,.....{{,....,,)},}})})).))).)))))).})||((,,(.{{|||||.,,{,|}}}.})}.},.)}}|(((((.(((..((.(.(((.((........))...)))}.)).))).)))))}((((((((((((...((.....))..))))))...(((((({{{.{.({{{{.,((((((((......((((......)))).((.(((((((((((((.,.,({{.....(((({(,,,..{{(((({(((.((((((..((.((.((.((((..(((((.((((((.,(((((.{{(,(.(((.(((......)))))).}.))}..)))))..,,.,))).))).))))).)))).)).))}).)))).)).)))||{|{{|..,,,.,,,,,}}}...}}}},}}}|,,,}))))),..}},)))){((((.{.((.((((((.(((...((...,},..)))..)))))))).).))))}{,{(((({{..((((...((((((((((...,..(((((((.((((.((.....)))))).)))....))))..,...))))))).)))....))))............,.,{{.{,....,..))}...}}}}}}(({{{(((,,,(((.((((((.{{..........|{{.(((......))).}}|,....,.{{{......})}.}}.|{|...}},,).)))))).))))))))))).,,,}))),,((((.....))))}}}......))))))))))))).)}......))))))))))).},)))})))))){(,......}),.))))))..,}))))....)))))))){((((((((.(((((((((((,{(({,{,||||,({{{,{{{{{..((((.,((((({((,..,||||.}}}}..(((((........))))).||||{.(((((((......(((((.((.....((((((((....)))).)))))))))))......))))))}...|||..,,|,,.,,,.|||||......((((((.((((.......)))))))))).,},,}}))}...|||{,,..}|||...(((((....((((((((({{.,||{,{.((.((((...(((.{((((.......))))}))))))))).....(((((((((((((((..............))))))))))))))).((((((({.(((((........))))).}))))))).,))),...)))))))))))....))))).,},,{{{{(((({..,{{..||||,|,...,,,.....,}}))))))}|}}}.,})}.}}|||||)),,,}}}}}.,,.{((((((((......))))))))}..,,,{((((((((({{(....}}.))))))))))}...)))))))))))(((((.((((.....)))).))))){{{({(..........,.....{(,.....))|,,..((((((((((..(((((.(((....(((((((((.....,.{{{{{{,((((...,,......,.,,,,..|..|||...,,)),,))|}|,|(((((((.,,,...,,,||,}......{(((({,.,||{((,..,|||}}})},,...}})}}})},)))))))...........)))))))))....))).)))))..))))))))))..,......)})))),{{{{{(({{.............}}}},}}})}....,{,{..((((((......))))))..,,,,))))))))}.......
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_003013.3 | GCCCCAGCAACGGCUCAUUCUGCUCCCCCGGGUCGGAGCCCCCCGGAGC… | 1996 nt | 0.5165 |
Summary
This gene encodes a member of the SFRP family that contains a cysteine-rich domain homologous to the putative Wnt-binding site of Frizzled proteins. SFRPs act as soluble modulators of Wnt signaling. Methylation of this gene is a potential marker for the presence of colorectal cancer. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
