Basic Information

Symbol
SFRP4
RNA Class
mRNA
Alias
secreted frizzled related protein 4 frpHE FRP-4 FRZB-2 secreted frizzled-related protein 4 PYL sFRP-4 frizzled protein, human endometrium secreted frizzled-related protein 4; secreted frizzled-related protein 4 FRPHE Secreted frizzled-related protein 4 Frizzled protein, human endometrium FrpHE
Location (GRCh38)
7:37905932-38025695 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_003014.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_003014.4
Sequence length
2868 nt
GC Content
0.4557

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-858.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -911.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 956.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.((((.(((((((((((((...((((.((.((..(((((.(..((((((.....((((...))))))))).)..).))))).)))).))))....)))).)))))))))))))...))))))).(((((.((.(((((.(((.(((((((((((((((.(((.(((.....))).)))))))))))..(((...(((.((((.....(((((((((((((((((.(.....).))))))))).)))(((.((((((((((((.((((((((((((................))))))))((((.(((((.((((..(((...(((((((.(((((((((((((....)).)))))))......((((.(((((....)))..)).))))..)))).))))))).)))..))))))))))))).(((((........)))))........((.(((((.((.((.((.(((...(((.((((((.....)))))).))).))).)))).)).))))))))))).))))).....((....))((((((.(........).)))))).((((((((((....)))))).))))).)))))).)))))))).....(((......))))))).)))....))).(((((((.....))..(((((((((..((((((((((.((.((......)).)))).)))))))).((((...))))(((((..((((((....))).)))..))))).)))).)))))..))))).......(((.......))).))))))).))).)))))))))))).....(((((.((((...(((((((..(((.(..(((..........)))..).)))...)))))))......(((((..(((((.(((...((((((((((((....((((((((((....(((....)))...))))..))))))......(((((...(((((((..(((((((((((((((((.((..(((....))).....(((((((((.......((((((.(.(((..((((.(((..(((((((......)))))))...(((((.((((((............)))))).)))))..((..(((((..(((((((((..(((((((((...((((.((...(((.(((.((((............(((((((......(..((..((((...........))))..))..)..(((........)))..((((((..................(((((((((((...((..((.((.(.....).)).))..))....(((((((.....))))))).((....((((...))))...))))))))))).)))))))).((((.....))))..))))))))))).))))))...)).)))).(((.(((....)))))).))))))))).)))))))))..).))))..)).............((((((((((........))))).)))))))).))))..))).).)))))).......))))))....))).....(((((((((.(((......))).)))).((((((...))))))........)))))............((((.((((((.(((((........))))))))))).......((((((((((((((((.(((....((((((((((..(((....(((...(..((((((((..((((.............))))..)))))..)))..)..)))..)))..))))))))))...)))..)))))))...)))))))))..)))).))))))))))..)))))))))...))))))))))))......((((((((..((((((((....)))).))))..))))))))...))))))))....(((((((((.........)))))))))...........................((((((.((((((((...)))))....))).))))))(((....(((((....)))))....)))..))))...))))))))...)))))...........((((((((((....((....)).....((((..((.((.(((((....)).))).)).))..))))...(((((((........))).))))..(((.((((........)))).)))......))))))))))....((((.(((....))).))))((((((.((((((.((((((..((.(((((((..(.........)..))))))).))....))))))...)))))).))))))..)))).)))))................(((((.((((((((..((((.((((......((((((((((((((((((..............(((((....))))).....(((((((.......................((((.....))))((((((((((((.((.(((........(((((.....)))))...........((((.......)))).........(((.(((.........))))))........((((..((((.((.((((((....((((((.......))))))....)))))).))..))))....))))))))).)))).))).))))).........)))))))..))))..))........))))))))))))..(((((.(...(.(((((((((((......(((((....)))))........(((((.((.(((.(((((...))))).).)).)).))))).))))))))))).).))))))...)))).)))).)))))))).))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.((((.(((((((((((((.,.((((.((.{{,.(((((,(,..(((((.....((((...})))))))).)}}),})))).},)}.)))).,..)))),)))))))))))))...))))))).((({{{((.(((((.(((.(((((((.(......,{{(((({((((,,.(((((.....)))))}||}..}},,{{||,.....||{||||{{||||.{|||,,,,,,,||}}}|,|}}|||((((,((((((((((({(((((..,,,,}},,}}}}}},,,....}}|)))))||||||{|||,{|||..{||}}}|(((((({(,,,||||||||({{.,||.||||,||{{{{,.((((.(((((....)))..)).))))..,),)})))),)},)),}}))))}}|||||||{((((({...{{{.|||||{{{{{{,.{{,{{,{||((.{(||||((,.,.(((.({(((({..,|)))))|,}}}.}}}.,,||||,.,))))}})),}.}}}))..,,.|{,|,|}}((((((.,........}.)))))).((((((((((....)))))).)))),.))))|}|},})}|.,,.,{{((({{,.{{{{.((.((((.{.....).)))).)),,,,.|,..||||||.....{{||||{{||,||,||,....,)}.)}||,})}}}})).{{{{,.,))))(((((..((((((....))).)))..))))))))))).)))),..)}))))}}}.}}}}).))))...).))))))).))).)))))))))))).....,{({{.,((({..,,||||,..{{{.{,.{{{.......,,{|||..},|||,..}}}}},),,,,.,|||||{{((((({{,(({.,..{(((((,(({,..{((((((((,{{,..,,{{{{{|{{..||||{.,,,..,......,,((({{...,(((({{(,,,,,,,..{{{((((((({({(,({..,.{.((((((.{{,((({((.({..(((((.,{((({,....}))}))...,,))))}.}}.)))))}...(((((.((((((............)))))).))))).....,{{{...})))}},},}},}|})}}})}..})})).}}..}})}}}))}),,))))}........((((((((((({..{{{,..{(({.....(((((((((.,(((((.{{(((........}}|.,|,,..{{((((({........,{{(((((((((((.,,{{..,...,.,.....},||.,,..,,.,,,(((((((.....))))))}.|{..|.((((...}))).}.}}))))))))).)}}|||{{{((((.....))))..})),))}..,|}},,,,,...,,.((((((((.(((....))))))....)))))..,}))))))..))},..}|}}||}}}}},}}}}|,||||,{{{{{........))))}}))))}.)))))))))...,..)).}}.,}}..))))))).....,||.....}}..(((((.(((......))).))))){(((((...)))))|{{({{.,,,{{{{{{{,,.......{{,..((((((.(((((........)))))))))))......,{{(({{((((.,,,,|}||,,,.|||||{{{{{{..,,||,,,{{({{.{,,(({{{((({{((({{{,.,,,,,{{,.,,..{{||||.{{{{{((({{|,,...,{{{||,|||||||{{{|||,,,,||||{..||,}}|||||.{|{{|{|||||||||,,,,||||||||{{{|{({{{{{.,,,,}}}}}{(((((((..((((((((....)))),,)))..)))))))}...,{{,|{{|,,,,(((((((((.......,,))))))))}..........,.,,,,,,,,{,...,{{,((((({,,(((((...)))))..,}}}},||||||{{|,..,|{{{{,,,,})))).},,{||}||||,,..,,,,,,,,,,,))))})))),})))),((((((((((.,,,((....}}.,...((((..({.((.(((((....)).))).)).})..))))...{((((((........))).))))..{((.((((........)))).))}......))))))))))....((((,(((....))).)))){{{{((.((((({,(((({{..{|||({(({{,.,........,),.,}})))).,..,,.)))))).,.)))))).)))))){{({{{{|,}}|{{{....{{{.....|||{,|,|,,|||||.}|||,.||||......||||||||||||,,||}}}}}......,..}}}}}}}.}))))......}}|||||||}}}}}}}}..,..}}}.},))),||||...}}))})}|||||||||||}||.}}}}}}....,(((((.....)))))....}}}}}..((((.......)))).,,,.....}}|.,}}}}}}}}..,|||{{..{{.{{{.,.,({{(({{.((.((((((....((((((.......))))))....)))))).))..})))}}....)))))))}),)).,,,.))))))}}}}....,))))))}})))}}}))...,{{{{|||||,,|||||,.(((({.(,..{.(((((((((((....,,((({(,,.,||}}}......,,|||{|,{{.,,,.(((({...})))).)}),,))}),,,,.))))))))))),).})))))...,,)),,}},.))))))))})}},,.

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_003014.4 GGCUGCGCUCCGAGCUGCGGAGUCCGGGACUGGAGCUGCCCGGGCGGGU… 2868 nt 0.4557
Summary

Secreted frizzled-related protein 4 (SFRP4) is a member of the SFRP family that contains a cysteine-rich domain homologous to the putative Wnt-binding site of Frizzled proteins. SFRPs act as soluble modulators of Wnt signaling. The expression of SFRP4 in ventricular myocardium correlates with apoptosis related gene expression. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image