Basic Information
Symbol
SFTPD
RNA Class
mRNA
Alias
surfactant protein D
SP-D
COLEC7
surfactant, pulmonary-associated protein D
PSP-D
SFTP4
pulmonary surfactant-associated protein D
collectin-7
lung surfactant protein D
pulmonary surfactant apoprotein
surfactant-associated protein, pulmonary 4
PSPD
Pulmonary surfactant-associated protein D
Collectin-7
Lung surfactant protein D
Location (GRCh38)
10:79937128-79983996
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_003019.5
Sequence length
1283 nt
GC Content
0.5838
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-526.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-547.2 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
436.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_003019.5 | AGUUUGCUUGGAGCUCCUGGGGCCUAACAAAAAGAAACCUGCCAUGCUG… | 1283 nt | 0.5838 |
Summary
The protein encoded by this gene is part of the innate immune response, protecting the lungs against inhaled microorganisms and chemicals. The encoded protein may also be involved in surfactant metabolism. [provided by RefSeq, Jul 2015]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
