Basic Information
Symbol
SHPRH
RNA Class
mRNA
Alias
SNF2 histone linker PHD RING helicase
FLJ90837
KIAA2023
bA545I5.2
SNF2 histone linker PHD RING helicase, E3 ubiquitin protein ligase
RAD5
E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH
2610103K11Rik
RING-type E3 ubiquitin transferase SHPRH
SNF2, histone-linker, PHD and RING finger domain-containing helicase
EC 2.3.2.27
EC 3.6.4.-
Location (GRCh38)
6:145864245-145964423
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001042683.3
Sequence length
7596 nt
GC Content
0.4131
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2142.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2290.13 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1927.5
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
SHPRH is a ubiquitously expressed protein that contains motifs characteristics of several DNA repair proteins, transcription factors, and helicases. SHPRH is a functional homolog of S. cerevisiae RAD5 (Unk et al., 2006 [PubMed 17108083]).[supplied by OMIM, Mar 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
