Basic Information
Symbol
SIX4
RNA Class
mRNA
Alias
SIX homeobox 4
AREC3
Homeobox protein SIX4
sine oculis homeobox (Drosophila) homolog 4
sine oculis homeobox homolog 4 (Drosophila)
sine oculis homeobox homolog 4
Sine oculis homeobox homolog 4
Location (GRCh38)
14:60709539-60724351
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_017420.5
Sequence length
6491 nt
GC Content
0.4241
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1901.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2025.25 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1521.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
This gene encodes a member of the homeobox family, subfamily SIX. The drosophila homolog is a nuclear homeoprotein required for eye development. Studies in mouse show that this gene product functions as a transcription factor, and may have a role in the differentiation or maturation of neuronal cells. [provided by RefSeq, May 2010]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
