Basic Information

Symbol
SLC22A12
RNA Class
mRNA
Alias
solute carrier family 22 member 12 OAT4L RST URAT1 hURAT1 UAT renal-specific transporter urate anion transporter 1 solute carrier family 22 (organic anion/cation transporter), member 12 solute carrier family 22 (organic anion/urate transporter), member 12 organic anion transporter 4-like protein urate anion exchanger 1 urate transporter 1 urate:anion antiporter SLC22A12 OATL4 Solute carrier family 22 member 12 Organic anion transporter 4-like protein Renal-specific transporter Urate anion exchanger 1 Urate:anion antiporter SLC22A12

Secondary Structure

MANE Select
NM_144585.4
Sequence length
2792 nt
GC Content
0.6275

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1209.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1255.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 608.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.................((((((((((....(((..(((((((...............)))))))..)))(((.((((((((((((((....((((((((.(((((..((.........((((....))))..(((((.(.(((.....))).).))))).(((....).))...))..))))))))))))))))...........(((((((.((((((((.....))))..((((((.......((((((((..(((((..(((((((.(((......)))..))).))))..((((((((.((((((.......)))))))))(.(((((...((((((((((((((...(((((((((((..(((.((.(((((..((((..(((((((((((.((...((((((..((((.((((...))))....).))))))))).)))))))))))))...))))((((((((((((.......))))))))).....(((.....)))...)))((((((((....((...((((((.((((((.((((...((..((.((((.(((....(.(((((((........((.....)).(((((((((..(((((...((((((.((..((((.(((((.((..(((((((((..(((((.((((((((((.((((((((((((.(.(((((((((((((.(((((...((......(((((..((((....))))....)))))...(((.((((((...))))))..))).)).)))))))))).))))))))))))))........((((((.(((((.....)))))))))))...((.((((..(((((.((((.(.((((.(((((..((..((.......))..))..)))))..)))).).)))).)))))..)))))).)))))).).))))....))).))).))))).....))))))))))).)))........)).))))...)).))).))).))))))))))))))))))))).)...))).)))).))..))..)))).)))))).))))))))...))))))))((((((((((((....((((.......))))....))))))))))))((((..((((((............(((.....))).....((((((.(((((((..(((....(((.......)))..((((((.(((.((((((((((.(((.((((.(((((((((...))))....((..(((((.(((((((((....(((........)))((((((..........))))))(((((((((...(((((((((....(((((.(((((((...(((...)))))))))).))).))....(((((.((((.........)))).)))))(((...)))............)).)))))))(((..(((..(((.((((((((...((((((...(((....((((((((.......))))))))...))).))))))(((((((....(((....))).....))).))))((((((.((((((((((.(((((((...)))))))...))).....(((.....(((.((.(((((........))))).)))))....)))..))))).))))))))(((((((((((((((((((((....(((((....(((((.((((.(((((((((..((((((((..(((...)))..))))))))(((((((.(((.(((((...((((((((....))))((((((..((((((((...)))))...))).))))))..(((((((.(((....))).))).)))).((((.(((....))))))))))).)))))))))))))))....))))))))).))))..............))))))))))....)))))).......((((....((((..(((((((..(((((((((((((((.......)))))))..(((((((((......((((((.....(((((((((...)))))))))..(((((((((.....(((((..........))))).)))))))))(((((((((....)))))).))).)))).))))))).(((((((((......))).))))))((((((...........))))))((((((((....))))))))...))))..........)))))..)))..)))))))..)))).....))))........(((((..((((((((((((((((.(((((.((.........))))))).))...)))))))))...)))))....))))).....))))))).)))))))).)))))))).))))))..)))...((((....))))......((((.((.(((.......))))).)))).)))))))))...(((((.....)))))))))))...))).)))))..))))))).)).)).))).))))))))))))))))))).))).....))))))).)))).))...................))))))..))))............))))).))))).....))))))))))).)))...)))))).))))).....))))).)...........))))))))))..))).))))).(((..(((......)))..))).((((((((((((((....)))....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..).)))).)))))))))................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.................((((((((({....(((..(((((((...............)))))))..)))(((.((((((((((((((....((((((((.(((((..((...{{,.{.((((,...))}}{.(((((.{.(((.....))).}.))})},|||...,},.,.,.)}..))))))))))))))))...........((((((,,(((({{(({{.{,|}}|,,{((((((..{{..((((((((..(((((..(({(({(,(((,.....}}}..))))}))}..{(((((((.((((((.......))))))))){.(((((,,.((((((((((((((...(((((((((((..(((.((.{((((..((({..(((((((((((.(,.,.((((((,.((({.((({...}})).,}.,.}}})))))),)))))))))))))...})}}({{(((((((((.......))))))))).,...{((.....}})..,))}((((((((....((...((((((.((((((.((((...((..((.((((.(((....{.(((((((........((.....}}.(((((((((..(((((..{(({,.{|||}.((((.(((((.({..(((((((((..(((((.((((((((((.((((((((((((.(.(((((((((((((,({(((...((,,{,..{((((..((((....))))....))))}....,{.((((({...}))))).,,}..)).)))))))))).)))))))))))))),,,..,{,((((((.(((((.....)))))))))))..,||.((((..(((((.((((.(.((((.(((((..((..((.......))..))..)))))..)))).).)))).)))))..))))}},)))))).).))))....)))}})).))))).....))))))))))).)))........)}.))))...|{{|.,..))}))))))))))))))))))))).,...))).)))).))..))..}))).)))))).))))))))...))))))))((((((((((({....((((,,.,...}})).,..))))))))))))((((..((((((............(((.....))).....((((({.(({({(({.(((,.({(((,......,,,..((((((.(((.((((((((((.(((.((((.((((((.(({{.{{......||..(((((.((({(((((....{{|{....,,{{||||||||...,}|{,.{{||||.((((((((({..(((((((((....(((((.(((((((...(((...)))))))))).))).))...,(((((.((({,.....,..)))).))))){((...)))............))},)))))){{{.,({{,.|||,((((((((...((((((...(((....((((((((.,....,))))))))...))).))))))(((((((.{.,(((....)))...,.)))},)))((((((.(({(((((((.(((((({...}))))))...))).....(((.....(((.((.(((((.,.....,))))).)})))....)))..))))).))))))))(((((((((((((((((((((....(((((....(((((.((((.(((((((((..((((((((..(({...}))..))))))))(((((({{(((.(((((...({({((((....))))((((((..((({((((...}})))...))).))))))..(((((((.(((....))).))).)))){((((.(((....))))))))))).)))))))))))))))....))))))))).))))...,.......,..))))))))))....)))))),...,..((((....((((..(((((((..((({((({{{,,{{{.......}}}}}}|,,,{{{(((({.,,{,.({.(((,{{{,(((((((((...))))))))}.,(((((((((.,,.,(({{{..........))))).)))))))))|{{{{{{||,,.,)))))),)))))))}.,.}}}}},(((((({{(,.....))}.))))))((((((...........))))))((((((((....))))))))...,))},,}}..,,,,)}}))},)))..)))))))..)))).....)))).},,,...(((((..((((((((((((((((.((({({((.........))))))).)),..}))))))))...)))))....))))).....))))))).)))))))).)))))))).)))))),})},.,,({{,....))))..,||,|{{{.{{.(((.......))))).))))|)))))))))...(((((.....))))))))))).,.))).)))))))))))))).)).)).))).))))))))))))))))))).))),...,,)))))).))),,,},....}}}}}.........))))))..))))............))))))),))).....))))))))))).)))...))))))))}))).,...))))).),,,......,,})),,)))))..))).)))))..}}...)))))),.})},,)}}.((((((((((((((....)))....)))))))))))},,.,.)))))))))))))))))))))..).))),.))))))))}................
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the organic anion transporter (OAT) family, and it acts as a urate transporter to regulate urate levels in blood. This protein is an integral membrane protein primarily found in epithelial cells of the proximal tubule of the kidney. An elevated level of serum urate, hyperuricemia, is associated with increased incidences of gout, and mutations in this gene cause renal hypouricemia type 1. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2013]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image