Basic Information
Symbol
SLC22A6
RNA Class
mRNA
Alias
solute carrier family 22 member 6
ROAT1
PAHT
OAT1
solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 6
HOAT1
PAH transporter
hPAHT
hROAT1
organic anion transporter 1
para-aminohippurate transporter
renal organic anion transporter 1
Solute carrier family 22 member 6
Organic anion transporter 1
hOAT1
Renal organic anion transporter 1
Location (GRCh38)
11:62936385-62984967
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_153276.3
Sequence length
2127 nt
GC Content
0.6060
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-898.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-929.8 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
543.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
The protein encoded by this gene is involved in the sodium-dependent transport and excretion of organic anions, some of which are potentially toxic. The encoded protein is an integral membrane protein and may be localized to the basolateral membrane. Four transcript variants encoding four different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
