Basic Information

Symbol
SLC2A1
RNA Class
mRNA
Alias
solute carrier family 2 member 1 DYT18 DYT9 GLUT-1 dystonia gene 18 dystonia gene 9 human T-cell leukemia virus (I and II) receptor choreoathetosis/spasticity, episodic (paroxysmal choreoathetosis/spasticity) solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 1 CSE DYT17 EIG12 GLUT GLUT1 GLUT1DS HTLVR PED SDCHCN solute carrier family 2, facilitated glucose transporter member 1 glucose transporter type 1, erythrocyte/brain hepG2 glucose transporter receptor for HTLV-1 and HTLV-2 Solute carrier family 2, facilitated glucose transporter member 1 Glucose transporter type 1, erythrocyte/brain HepG2 glucose transporter
Location (GRCh38)
1:42925353-42958893 UCSC Genome Browser

Secondary Structure

MANE Select
NM_006516.4
Sequence length
3384 nt
GC Content
0.5334

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1227.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1288.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 668.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

This gene encodes a major glucose transporter in the mammalian blood-brain barrier. The encoded protein is found primarily in the cell membrane and on the cell surface, where it can also function as a receptor for human T-cell leukemia virus (HTLV) I and II. Mutations in this gene have been found in a family with paroxysmal exertion-induced dyskinesia. [provided by RefSeq, Apr 2013]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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