Basic Information

Symbol
SMAP2
RNA Class
mRNA
Alias
small ArfGAP2 stromal membrane-associated protein 1-like stromal membrane-associated GTPase-activating protein 2 SMAP1L stromal membrane-associated protein 2 Stromal membrane-associated protein 2 Stromal membrane-associated protein 1-like
Location (GRCh38)
1:40344850-40423326 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001198978.2
BLAST PRIMER
NM_001198979.2
BLAST PRIMER
NM_001198980.1
BLAST PRIMER
NM_022733.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_022733.3
Sequence length
2905 nt
GC Content
0.5253

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1046.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1099.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 777.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((((((((((((....))))).)).(((...(((.((((((((((.(..((((.((......)).))))...).)))..))))))))))..)))(((((((((.((((((((((((((((.(((((.((((((((((((((((.((((((...))))))......((((((..((((......)))).(((((((....))).))))....))))))(((((((((...........))))))))).))))))))))))..((((((((((((((((((((.......))))))))))).....))))))))).))))))).)).))))))))))...(((((((..((((((((...)))))))))))))))...(((((((((.....(((((((......(((((((.(((.((((((((((((....))))).......((((..((((((((............(((((((((((((((((((.(((((......))))).)))))...)))))).....))))))))..((((((.((.(.(((.(((....)))))).).)))))))).((((.((((..(((((.(...(((..((((((((((((((((((((((.(((.....((((.(((...(((..((((.....((((((((((((.(((((((((((((....))))).))....)))))).((((((((((..((((....(((..((.....((..(((((((((....(((((.....(((.(((((((((.((((......((.(((...((((((.(((((...(.((((((...((.(((((((........)))))))((((.((((((......(((.......)))........))))))..)))).......))....)))))))....)))))......))))))...))).)))))).)))))).)))...))).(((......))).((((..((.((((((.....(((((......)))))...)))))).)))))))))))....)))))))))..))))..)))(((((((.((....((((((.(((..((((((...(((..((((..(((...(((((...(((((((.......)))))))..))))).....((((((.......(((((.....((.(((((.(.......).)))))))..))).))......)))))).)))))))..)))....))))))...))).))))))..)).)))))))(((((.........)))))......))))))))))....))))((((((.((((((.(....).)))))).).))))).((((((((...(((((..((..((.(((((.(..(((((((((.(((((....))))).)))))))))...).))))).))(((...(((..((.....)).)))...)))((((((..(((..(((((((((((...........(((.(((.(((.((((..(((((....)))))...)))).)))))).)))((((..(((((((((((((((............((((((((.(((.((..(((....(((.(((....(((.(((.(((..(((..((((((....(((........(((........)))................)))....))))))..))).))).))))))))).)))...)))..)))))...(((((((((...........((((..(((.........)))...))))...........))))...)))))))))).)))..))))))))((((........)))).....)))))))..))))))))).))))))))))))))).........))..)))))....)))))))).((((((.((....)).))))))..(((((.(((((((.((((.(.......).))))..))))))).)))))((((.(((((....(((((((((((((((....))))))))....((((........)))).)))))))..))))).))))....(((....(((((((((((((.((((.((((......))))))))))).....(((((((((...)))))))))..(((((((.(((((...............((((((((((.((((..((((.((((((....)))))).))))..))))((((....))))..((((((..........(((........)))))))))...)))))))))).))))).)))))))(((......)))..))))))))))...))))))))))))).)).(((((((..((((((((...(((((((..........((((((((.(((......)))...)))))))).............))))))).(((..(((((.(((((((.((....)))))))))))))).)))))))))))....)))))))....)))).))))))))))......))).))))))....)))))))))..........)))))))....(((((((((........((((((.......)))))).)))))))))(((((.........))))))))...).)))))..))))..))))..)))))))))))).))))))))))))))))))))))))....)))))))))((((((((..((((.......))))...)))))))))))))).))..)).)))))..(((..(((((....(((((((((....))))(((.((((.((((.....)))).)))).))))))))....)))))..)))))))))..)))))..............(((((((((....)))).))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.(((((((((((((..,,|}}}}})).((,...||{.(({((,(((({({.((((.,,.....}))}||||...,})))..,))))))),)}.))}(((((((((.((((((((((((((((.(((((.((((((((((((((((.((((((...}))))),,,...{(((((..((((......)))).(((((((....))).))))....)))))|((((((((({......},..))))))))),))))))))))))..((((((((((((((((((((.,....,))))))))))).....))))))))).))))))).)).))))))))))...{((((((..((((((((...))))))))))))))}..,(((((((((..,,.(((((({.....,(((((((.(({{((((((((((((....))))).......{{{(,,((((((((............(((((((((((((((((((.(((((......))))).))))}...)))))).....))))))))..((((((.((.,,(((.(((....)))}))}).)))))))).((((.((((..(((((.,.,,(({..{((({{,(((((((((((((((.(((,{...((({(((((..((({{,{({...|,((((((((((((.(({((({{(((((.,,.|}}}}.}}.||,))||)),....{{((((((..(((({.,{,,({,((((((.((((.(.,((({.....(((..,..(((,((.((((,,((((....(({{{(({.{((..(,...{(((((.((((((((({({{..(((((((........)))))))..)))|{{{((,......,}}}}},(((((((.......(((.((((({,.....{(((.........)))|((((((,,({..,,))..)))))))),}))).))).......))))))).}})))}.{(((.....))}}..((((((.....(((((......)))))...))))))})))).))))))}..))).)))))))(((((((,,.(((((((.((,,,,((((((.(((,.((((((,,.(((.,((({.,{{,...(((((...(((((((.......)))))))..))))).....{(((({.,,....({,|{||...((.(((({.{.......}.}))))}}..))).))......}))))}.}},,)}}..)}},.,,)))))}...))).)||}}}..}),}}})))},{(((,{{,.....|||||...|||||{{,..|||....|||,((((((.((((((.,....).)))))).),,)))).,||}..})}|,{||||}{|||(((({(((({{{,({(((((({.{{{{{.,,,|||||,|}}}}||||,..,.,})}),)}))|....,,....,,}.))))))))}))))))))}.,,|||,.||||{((,,.))))))),||..(((.{({.{({,{(((..(((({....)))))...)))),)))))).))).,,.((((((.....))))))....,,})}..}))))))...)))))))))..{{.((((.{(.....((({(((,({{..(((..((((((....{{({{{...,}||,.,,{.,{{|,..............}}.)))....))))))..))}.))).))),,})))}....)).)))).}}...,,,..}}.)))..}..)))...)))}.}.}.)))))))))).,)}.})))))..)))))},)),,|{|||((,,{(((.....,,,..)))}..|}}}}},...|{{(((((((,,{{{((((,{({({{,,,,|{((,,...||,....,..,...((((((((({{{..,(({.,,{(((({.{,....,),))}))}}}}.))).......)))).))))).{(((((({,(((({((((........))))}||,....{{.|||,.((((((((....)))))))),))),)))))))))}.))),,,}})})},,}))..))))))},}}}.....((((((((((((({,,,{.{(((,,,,..}|||||,,}||.{{{,{{(((((({...}))))))))}}{(((((,.((({,...........,|||(((.(((,,..((((({...})))))..)))).))))|((((,..{{..|,||{...(((((.(((.,.........))))))))(((({||{|{.|.....)}),,})))))})))).}))))))}}}},,..))))..))))))))))...,}.)))))))))).)).((((((({.(((((({{..,(((({((,.....(((((,....}})))....||,,....})),)))))......{{{....,,))),|.(((..(({{.,((({(((.{{....)})))})))))))),)))))))))))....))))))}}))))..)))))..})))}..},..))).)))))}...,)))))))))..,{{{{{{{||||.,,....{{{{{{......,,,..,,,,||}}}}}}})))}}|||{{{||.,{{,{{,.,.,,,}},)))))),}...}.)))))..))))..))))..)))))))))))).)))))))))))))))))))))))).,..)))))))))|(((((((..((((.......))))...)))))))})))))).)}.,))}}}))}..{{{..,{{{{.,.,({(((,(((....}}|}(((.((((.((((.....)))).)))).))))))))..,.}))))}})}}))))))..)))))..............{{(({{{{{....)))).))))}.
Summary

Predicted to enable GTPase activator activity. Located in cytosol and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image