Basic Information

Symbol
SMARCA5
RNA Class
mRNA
Alias
SNF2 related chromatin remodeling ATPase 5 hSNF2H hISWI ISWI SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5 SNF2H WCRF135 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin A5 sucrose nonfermenting protein 2 homolog sucrose nonfermenting-like 5 Sucrose nonfermenting protein 2 homolog EC 3.6.4.- EC 3.6.1
Location (GRCh38)
4:143513445-143557486 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_003601.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_003601.4
Sequence length
7684 nt
GC Content
0.3837

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1999.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2150.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2256.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

The protein encoded by this gene is a member of the SWI/SNF family of proteins. Members of this family have helicase and ATPase activities and are thought to regulate transcription of certain genes by altering the chromatin structure around those genes. The protein encoded by this gene is a component of the chromatin remodeling and spacing factor RSF, a facilitator of the transcription of class II genes by RNA polymerase II. The encoded protein is similar in sequence to the Drosophila ISWI chromatin remodeling protein. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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