Basic Information
Symbol
SMARCC1
RNA Class
mRNA
Alias
SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit C1
BAF155
SRG3
Rsc8
CRACC1
SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 1
SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily c, member 1
HYC5
SWI3
SWI/SNF complex subunit SMARCC1
BRG1-associated factor 155
SWI/SNF complex 155 kDa subunit
SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily C member 1
chromatin remodeling complex BAF155 subunit
mammalian chromatin remodeling complex BRG1-associated factor 155
Location (GRCh38)
3:47585269-47782106
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_003074.4
Sequence length
6354 nt
GC Content
0.4647
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1999.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2116.46 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1946.0
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Summary
The protein encoded by this gene is a member of the SWI/SNF family of proteins, whose members display helicase and ATPase activities and which are thought to regulate transcription of certain genes by altering the chromatin structure around those genes. The encoded protein is part of the large ATP-dependent chromatin remodeling complex SNF/SWI and contains a predicted leucine zipper motif typical of many transcription factors. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
